Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / randist / rayleigh.c
1 /* randist/rayleigh.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_rng.h>
23 #include <gsl/gsl_randist.h>
24
25 /* The Rayleigh distribution has the form
26
27    p(x) dx = (x / sigma^2) exp(-x^2/(2 sigma^2)) dx
28
29    for x = 0 ... +infty */
30
31 double
32 gsl_ran_rayleigh (const gsl_rng * r, const double sigma)
33 {
34   double u = gsl_rng_uniform_pos (r);
35
36   return sigma * sqrt(-2.0 * log (u));
37 }
38
39 double
40 gsl_ran_rayleigh_pdf (const double x, const double sigma)
41 {
42   if (x < 0)
43     {
44       return 0 ;
45     }
46   else
47     {
48       double u = x / sigma ;
49       double p = (u / sigma) * exp(-u * u / 2.0) ;
50       
51       return p;
52     }
53 }
54
55 /* The Rayleigh tail distribution has the form
56
57    p(x) dx = (x / sigma^2) exp((a^2 - x^2)/(2 sigma^2)) dx
58
59    for x = a ... +infty */
60
61 double
62 gsl_ran_rayleigh_tail (const gsl_rng * r, const double a, const double sigma)
63 {
64   double u = gsl_rng_uniform_pos (r);
65
66   return sqrt(a * a - 2.0 * sigma * sigma * log (u));
67 }
68
69 double
70 gsl_ran_rayleigh_tail_pdf (const double x, const double a, const double sigma)
71 {
72   if (x < a)
73     {
74       return 0 ;
75     }
76   else
77     {
78       double u = x / sigma ;
79       double v = a / sigma ;
80
81       double p = (u / sigma) * exp((v + u) * (v - u) / 2.0) ;
82       
83       return p;
84     }
85 }