Added MACS source
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / rng / mrg.c
1 /* rng/mrg.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <stdlib.h>
22 #include <gsl/gsl_rng.h>
23
24 /* This is a fifth-order multiple recursive generator. The sequence is,
25
26    x_n = (a_1 x_{n-1} + a_5 x_{n-5}) mod m
27
28    with a_1 = 107374182, a_2 = a_3 = a_4 = 0, a_5 = 104480 and m = 2^31-1.
29
30    We initialize the generator with x_n = s_n MOD m for n = 1..5,
31    where s_n = (69069 * s_{n-1}) mod 2^32, and s_0 = s is the
32    user-supplied seed.
33
34    NOTE: According to the paper the seeds must lie in the range [0,
35    2^31 - 2] with at least one non-zero value -- our seeding procedure
36    satisfies these constraints.
37
38    We then use 6 iterations of the generator to "warm up" the internal
39    state.
40
41    With this initialization procedure the theoretical value of
42    z_{10006} is 2064828650 for s = 1. The subscript 10006 means (1)
43    seed the generator with s = 1, (2) do the 6 warm-up iterations
44    that are part of the seeding process, (3) then do 10000 actual
45    iterations.
46
47    The period of this generator is about 2^155.
48
49    From: P. L'Ecuyer, F. Blouin, and R. Coutre, "A search for good
50    multiple recursive random number generators", ACM Transactions on
51    Modeling and Computer Simulation 3, 87-98 (1993). */
52
53 static inline unsigned long int mrg_get (void *vstate);
54 static double mrg_get_double (void *vstate);
55 static void mrg_set (void *state, unsigned long int s);
56
57 static const long int m = 2147483647;
58 static const long int a1 = 107374182, q1 = 20, r1 = 7;
59 static const long int a5 = 104480, q5 = 20554, r5 = 1727;
60
61 typedef struct
62   {
63     long int x1, x2, x3, x4, x5;
64   }
65 mrg_state_t;
66
67 static inline unsigned long int
68 mrg_get (void *vstate)
69 {
70   mrg_state_t *state = (mrg_state_t *) vstate;
71
72   long int p1, h1, p5, h5;
73
74   h5 = state->x5 / q5;
75   p5 = a5 * (state->x5 - h5 * q5) - h5 * r5;
76   if (p5 > 0)
77     p5 -= m;
78
79   h1 = state->x1 / q1;
80   p1 = a1 * (state->x1 - h1 * q1) - h1 * r1;
81   if (p1 < 0)
82     p1 += m;
83
84   state->x5 = state->x4;
85   state->x4 = state->x3;
86   state->x3 = state->x2;
87   state->x2 = state->x1;
88
89   state->x1 = p1 + p5;
90
91   if (state->x1 < 0)
92     state->x1 += m;
93
94   return state->x1;
95 }
96
97 static double
98 mrg_get_double (void *vstate)
99 {
100   return mrg_get (vstate) / 2147483647.0 ;
101 }
102
103
104 static void
105 mrg_set (void *vstate, unsigned long int s)
106 {
107   /* An entirely adhoc way of seeding! This does **not** come from
108      L'Ecuyer et al */
109
110   mrg_state_t *state = (mrg_state_t *) vstate;
111
112   if (s == 0)
113     s = 1;      /* default seed is 1 */
114
115 #define LCG(n) ((69069 * n) & 0xffffffffUL)
116   s = LCG (s);
117   state->x1 = s % m;
118   s = LCG (s);
119   state->x2 = s % m;
120   s = LCG (s);
121   state->x3 = s % m;
122   s = LCG (s);
123   state->x4 = s % m;
124   s = LCG (s);
125   state->x5 = s % m;
126
127   /* "warm it up" with at least 5 calls to go through
128      all the x values */
129
130   mrg_get (state);
131   mrg_get (state);
132   mrg_get (state);
133   mrg_get (state);
134   mrg_get (state);
135   mrg_get (state);
136
137   return;
138 }
139
140 static const gsl_rng_type mrg_type =
141 {"mrg",                         /* name */
142  2147483646,                    /* RAND_MAX */
143  0,                             /* RAND_MIN */
144  sizeof (mrg_state_t),
145  &mrg_set,
146  &mrg_get,
147  &mrg_get_double};
148
149 const gsl_rng_type *gsl_rng_mrg = &mrg_type;