Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / rng / ran2.c
1 /* rng/ran2.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <stdlib.h>
22 #include <gsl/gsl_rng.h>
23
24 /* This is an implementation of the algorithm used in Numerical
25    Recipe's ran2 generator.  It is a L'Ecuyer combined recursive
26    generator with a 32-element shuffle-box.
27
28    As far as I can tell, in general the effects of adding a shuffle
29    box cannot be proven theoretically, so the period of this generator
30    is unknown. 
31
32    The period of the underlying combined generator is O(2^60). */
33
34 static inline unsigned long int ran2_get (void *vstate);
35 static double ran2_get_double (void *vstate);
36 static void ran2_set (void *state, unsigned long int s);
37
38 static const long int m1 = 2147483563, a1 = 40014, q1 = 53668, r1 = 12211;
39 static const long int m2 = 2147483399, a2 = 40692, q2 = 52774, r2 = 3791;
40
41 #define N_SHUFFLE 32
42 #define N_DIV (1 + 2147483562/N_SHUFFLE)
43
44 typedef struct
45   {
46     unsigned long int x;
47     unsigned long int y;
48     unsigned long int n;
49     unsigned long int shuffle[N_SHUFFLE];
50   }
51 ran2_state_t;
52
53 static inline unsigned long int
54 ran2_get (void *vstate)
55 {
56   ran2_state_t *state = (ran2_state_t *) vstate;
57
58   const unsigned long int x = state->x;
59   const unsigned long int y = state->y;
60
61   long int h1 = x / q1;
62   long int t1 = a1 * (x - h1 * q1) - h1 * r1;
63
64   long int h2 = y / q2;
65   long int t2 = a2 * (y - h2 * q2) - h2 * r2;
66
67   if (t1 < 0)
68     t1 += m1;
69
70   if (t2 < 0)
71     t2 += m2;
72
73   state->x = t1;
74   state->y = t2;
75
76   {
77     unsigned long int j = state->n / N_DIV;
78     long int delta = state->shuffle[j] - t2;
79     if (delta < 1)
80       delta += m1 - 1;
81     state->n = delta;
82     state->shuffle[j] = t1;
83   }
84
85   return state->n;
86 }
87
88 static double
89 ran2_get_double (void *vstate)
90 {
91   float x_max = 1 - 1.2e-7f ; /* Numerical Recipes version of 1-FLT_EPS */
92
93   float x = ran2_get (vstate) / 2147483563.0f ;
94  
95   if (x > x_max) 
96     return x_max ;
97   
98   return x ;
99 }
100
101 static void
102 ran2_set (void *vstate, unsigned long int s)
103 {
104   ran2_state_t *state = (ran2_state_t *) vstate;
105   int i;
106
107   if (s == 0)
108     s = 1;      /* default seed is 1 */
109
110   state->y = s;
111
112   for (i = 0; i < 8; i++)
113     {
114       long int h = s / q1;
115       long int t = a1 * (s - h * q1) - h * r1;
116       if (t < 0)
117         t += m1;
118       s = t;
119     }
120
121   for (i = N_SHUFFLE - 1; i >= 0; i--)
122     {
123       long int h = s / q1;
124       long int t = a1 * (s - h * q1) - h * r1;
125       if (t < 0)
126         t += m1;
127       s = t;
128       state->shuffle[i] = s;
129     }
130
131   state->x = s;
132   state->n = s;
133
134   return;
135 }
136
137 static const gsl_rng_type ran2_type =
138 {"ran2",                        /* name */
139  2147483562,                    /* RAND_MAX */
140  1,                             /* RAND_MIN */
141  sizeof (ran2_state_t),
142  &ran2_set,
143  &ran2_get,
144  &ran2_get_double};
145
146 const gsl_rng_type *gsl_rng_ran2 = &ran2_type;