Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / rng / ranlxd.c
1 /* rng/ranlxd.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <stdlib.h>
22 #include <gsl/gsl_rng.h>
23
24 /* This is an implementation of Martin Luescher's second generation
25    double-precision (48-bit) version of the RANLUX generator. 
26
27    Thanks to Martin Luescher for providing information on this
28    generator.
29
30 */
31
32 static inline unsigned long int ranlxd_get (void *vstate);
33 static double ranlxd_get_double (void *vstate);
34 static void ranlxd_set_lux (void *state, unsigned long int s, unsigned int luxury);
35 static void ranlxd1_set (void *state, unsigned long int s);
36 static void ranlxd2_set (void *state, unsigned long int s);
37
38 static const int next[12] = {1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 0};
39
40 static const double one_bit = 1.0 / 281474976710656.0;  /* 1/2^48 */
41
42 #define RANLUX_STEP(x1,x2,i1,i2,i3)      \
43           x1=xdbl[i1] - xdbl[i2];        \
44           if (x2 < 0)                    \
45           {                              \
46             x1-=one_bit;                 \
47             x2+=1;                       \
48           }                              \
49          xdbl[i3]=x2
50
51 typedef struct
52   {
53     double xdbl[12]; 
54     double carry;
55     unsigned int ir;
56     unsigned int jr;
57     unsigned int ir_old;
58     unsigned int pr;
59   }
60 ranlxd_state_t;
61
62 static inline void increment_state (ranlxd_state_t * state);
63
64 static inline void
65 increment_state (ranlxd_state_t * state)
66 {
67   int k, kmax;
68   double y1, y2, y3;
69
70   double *xdbl = state->xdbl;
71   double carry = state->carry;
72   unsigned int ir = state->ir;
73   unsigned int jr = state->jr;
74
75   for (k = 0; ir > 0; ++k)
76     {
77       y1 = xdbl[jr] - xdbl[ir];
78       y2 = y1 - carry;
79       if (y2 < 0)
80         {
81           carry = one_bit;
82           y2 += 1;
83         }
84       else
85         {
86           carry = 0;
87         }
88       xdbl[ir] = y2;
89       ir = next[ir];
90       jr = next[jr];
91     }
92
93   kmax = state->pr - 12;
94
95   for (; k <= kmax; k += 12)
96     {
97       y1 = xdbl[7] - xdbl[0];
98       y1 -= carry;
99
100       RANLUX_STEP (y2, y1, 8, 1, 0);
101       RANLUX_STEP (y3, y2, 9, 2, 1);
102       RANLUX_STEP (y1, y3, 10, 3, 2);
103       RANLUX_STEP (y2, y1, 11, 4, 3);
104       RANLUX_STEP (y3, y2, 0, 5, 4);
105       RANLUX_STEP (y1, y3, 1, 6, 5);
106       RANLUX_STEP (y2, y1, 2, 7, 6);
107       RANLUX_STEP (y3, y2, 3, 8, 7);
108       RANLUX_STEP (y1, y3, 4, 9, 8);
109       RANLUX_STEP (y2, y1, 5, 10, 9);
110       RANLUX_STEP (y3, y2, 6, 11, 10);
111
112       if (y3 < 0)
113         {
114           carry = one_bit;
115           y3 += 1;
116         }
117       else
118         {
119           carry = 0;
120         }
121       xdbl[11] = y3;
122     }
123
124   kmax = state->pr;
125
126   for (; k < kmax; ++k)
127     {
128       y1 = xdbl[jr] - xdbl[ir];
129       y2 = y1 - carry;
130       if (y2 < 0)
131         {
132           carry = one_bit;
133           y2 += 1;
134         }
135       else
136         {
137           carry = 0;
138         }
139       xdbl[ir] = y2;
140       ir = next[ir];
141       jr = next[jr];
142     }
143   state->ir = ir;
144   state->ir_old = ir;
145   state->jr = jr;
146   state->carry = carry;
147 }
148
149 static inline unsigned long int
150 ranlxd_get (void *vstate)
151 {
152   return ranlxd_get_double (vstate) * 4294967296.0;     /* 2^32 */
153 }
154
155 static double
156 ranlxd_get_double (void *vstate)
157 {
158   ranlxd_state_t *state = (ranlxd_state_t *) vstate;
159
160   int ir = state->ir;
161
162   state->ir = next[ir];
163
164   if (state->ir == state->ir_old)
165     increment_state (state);
166
167   return state->xdbl[state->ir];
168 }
169
170 static void
171 ranlxd_set_lux (void *vstate, unsigned long int s, unsigned int luxury)
172 {
173   ranlxd_state_t *state = (ranlxd_state_t *) vstate;
174
175   int ibit, jbit, i, k, l, xbit[31];
176   double x, y;
177
178   long int seed;
179
180   if (s == 0)
181     s = 1;                      /* default seed is 1 */
182
183   seed = s;
184
185   i = seed & 0xFFFFFFFFUL;
186
187   for (k = 0; k < 31; ++k)
188     {
189       xbit[k] = i % 2;
190       i /= 2;
191     }
192
193   ibit = 0;
194   jbit = 18;
195
196   for (k = 0; k < 12; ++k)
197     {
198       x = 0;
199
200       for (l = 1; l <= 48; ++l)
201         {
202           y = (double) ((xbit[ibit] + 1) % 2);
203           x += x + y;
204           xbit[ibit] = (xbit[ibit] + xbit[jbit]) % 2;
205           ibit = (ibit + 1) % 31;
206           jbit = (jbit + 1) % 31;
207         }
208       state->xdbl[k] = one_bit * x;
209     }
210
211   state->carry = 0;
212   state->ir = 11;
213   state->jr = 7;
214   state->ir_old = 0;
215   state->pr = luxury;
216 }
217
218 static void
219 ranlxd1_set (void *vstate, unsigned long int s)
220 {
221   ranlxd_set_lux (vstate, s, 202);
222 }
223
224 static void
225 ranlxd2_set (void *vstate, unsigned long int s)
226 {
227   ranlxd_set_lux (vstate, s, 397);
228 }
229
230 static const gsl_rng_type ranlxd1_type =
231 {"ranlxd1",                     /* name */
232  0xffffffffUL,                  /* RAND_MAX */
233  0,                             /* RAND_MIN */
234  sizeof (ranlxd_state_t),
235  &ranlxd1_set,
236  &ranlxd_get,
237  &ranlxd_get_double};
238
239 static const gsl_rng_type ranlxd2_type =
240 {"ranlxd2",                     /* name */
241  0xffffffffUL,                  /* RAND_MAX */
242  0,                             /* RAND_MIN */
243  sizeof (ranlxd_state_t),
244  &ranlxd2_set,
245  &ranlxd_get,
246  &ranlxd_get_double};
247
248 const gsl_rng_type *gsl_rng_ranlxd1 = &ranlxd1_type;
249 const gsl_rng_type *gsl_rng_ranlxd2 = &ranlxd2_type;