Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / roots / gsl_roots.h
1 /* roots/gsl_roots.h
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Reid Priedhorsky, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #ifndef __GSL_ROOTS_H__
21 #define __GSL_ROOTS_H__
22
23 #include <stdlib.h>
24 #include <gsl/gsl_types.h>
25 #include <gsl/gsl_math.h>
26
27 #undef __BEGIN_DECLS
28 #undef __END_DECLS
29 #ifdef __cplusplus
30 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
31 # define __END_DECLS }
32 #else
33 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
34 # define __END_DECLS /* empty */
35 #endif
36
37 __BEGIN_DECLS
38
39 typedef struct
40   {
41     const char *name;
42     size_t size;
43     int (*set) (void *state, gsl_function * f, double * root, double x_lower, double x_upper);
44     int (*iterate) (void *state, gsl_function * f, double * root, double * x_lower, double * x_upper);
45   }
46 gsl_root_fsolver_type;
47
48 typedef struct
49   {
50     const gsl_root_fsolver_type * type;
51     gsl_function * function ;
52     double root ;
53     double x_lower;
54     double x_upper;
55     void *state;
56   }
57 gsl_root_fsolver;
58
59 typedef struct
60   {
61     const char *name;
62     size_t size;
63     int (*set) (void *state, gsl_function_fdf * f, double * root);
64     int (*iterate) (void *state, gsl_function_fdf * f, double * root);
65   }
66 gsl_root_fdfsolver_type;
67
68 typedef struct
69   {
70     const gsl_root_fdfsolver_type * type;
71     gsl_function_fdf * fdf ;
72     double root ;
73     void *state;
74   }
75 gsl_root_fdfsolver;
76
77 gsl_root_fsolver *
78 gsl_root_fsolver_alloc (const gsl_root_fsolver_type * T);
79 void gsl_root_fsolver_free (gsl_root_fsolver * s);
80
81 int gsl_root_fsolver_set (gsl_root_fsolver * s,
82                           gsl_function * f, 
83                           double x_lower, double x_upper);
84
85 int gsl_root_fsolver_iterate (gsl_root_fsolver * s);
86
87 const char * gsl_root_fsolver_name (const gsl_root_fsolver * s);
88 double gsl_root_fsolver_root (const gsl_root_fsolver * s);
89 double gsl_root_fsolver_x_lower (const gsl_root_fsolver * s);
90 double gsl_root_fsolver_x_upper (const gsl_root_fsolver * s);
91
92
93 gsl_root_fdfsolver *
94 gsl_root_fdfsolver_alloc (const gsl_root_fdfsolver_type * T);
95
96 int
97 gsl_root_fdfsolver_set (gsl_root_fdfsolver * s, 
98                          gsl_function_fdf * fdf, double root);
99
100 int
101 gsl_root_fdfsolver_iterate (gsl_root_fdfsolver * s);
102
103 void
104 gsl_root_fdfsolver_free (gsl_root_fdfsolver * s);
105
106 const char * gsl_root_fdfsolver_name (const gsl_root_fdfsolver * s);
107 double gsl_root_fdfsolver_root (const gsl_root_fdfsolver * s);
108
109 int
110 gsl_root_test_interval (double x_lower, double x_upper, double epsabs, double epsrel);
111
112 int
113 gsl_root_test_residual (double f, double epsabs);
114
115 int
116 gsl_root_test_delta (double x1, double x0, double epsabs, double epsrel);
117
118 GSL_VAR const gsl_root_fsolver_type  * gsl_root_fsolver_bisection;
119 GSL_VAR const gsl_root_fsolver_type  * gsl_root_fsolver_brent;
120 GSL_VAR const gsl_root_fsolver_type  * gsl_root_fsolver_falsepos;
121 GSL_VAR const gsl_root_fdfsolver_type  * gsl_root_fdfsolver_newton;
122 GSL_VAR const gsl_root_fdfsolver_type  * gsl_root_fdfsolver_secant;
123 GSL_VAR const gsl_root_fdfsolver_type  * gsl_root_fdfsolver_steffenson;
124
125 __END_DECLS
126
127 #endif /* __GSL_ROOTS_H__ */