htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/siman/ChangeLog

   1 2007-05-30  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
   2
   3         * siman.c (boltzmann): moved safe_exp into boltzmann
   4         (copy_state): put all copying into one function
   5
   6 2006-03-08  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
   7
   8         * test.c (square): removed inline since it causes problems with
   9         some compilers
  10
  11 2005-11-14  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
  12
  13         * siman.c (safe_exp): added a safe_exp function to avoid underflow
  14         for large uphill steps
  15
  16 2003-03-31  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
  17
  18         * siman.c (gsl_siman_solve): avoid reevaluation for best_E
  19         (gsl_siman_solve): loop over param.iters_fixed_T not
  20         params.n_tries
  21         (gsl_siman_solve): initialise energy at start
  22
  23 Sat Aug  3 20:32:38 2002  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
  24
  25         * siman.c (gsl_siman_solve): fix acceptance criterion to match
  26         documentation (Peter S. Christopher)
  27
  28 Thu Jun 13 20:57:00 2002  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
  29
  30         * siman.c (gsl_siman_solve): keep track of the best result
  31
  32 2002-02-07  Mark Galassi  <rosalia@galassi.org>
  33
  34         * siman.c (gsl_siman_solve): bug fix in the destructor for x and
  35         new_x which was being called on &x and &new_x instead of x and
  36         new_x; thanks to Karsten Howes <karsten@videotron.ca>
  37
  38 Thu Jul 12 21:50:07 2001  Brian Gough  <bjg@network-theory.co.uk>
  39
  40         * gsl_siman.h: changed renamed gsl_Efunc_t to gsl_siman_Efunc_t,
  41         in accordance with namespace conventions
  42
  43 2000-12-15  Mark Galassi  <rosalia@galassi.org>
  44
  45         * siman.c (gsl_siman_solve): reversed a small change I had made
  46         earlier and went back to taking Boltzmann-conditional steps when
  47         the new energy is equal to the previous one.  This allows you to
  48         move around if you are stuck on a plateau.
  49
  50         * gsl_siman.h, siman.c, siman_test.c, siman_tsp.c, test.c: changed
  51         the siman_solve API to allow for more general search spaces.  The
  52         problem was that we assumed that points in the search space were
  53         data structures that were allocated in continguous memory, so they
  54         could not be linked structures.  I replaced the malloc(), memcpy()
  55         and free() calls with copy_constructor(), copyfunc() and
  56         copy_destructor() functions.  The user passes these functions,
  57         which means that siman_solve() now takes three more arguments of
  58         type gsl_siman_copy_t, gsl_siman_copy_construct_t and
  59         gsl_siman_destroy_t.  If these arguments are NULL (and all three
  60         of them have to be NULL together), the traditional memcpy()
  61         approach is used.
  62
  63 1999-02-14  Mark Galassi  <rosalia@cygnus.com>
  64
  65         * minor fixes.
  66
  67 Tue Nov 17 17:22:14 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
  68
  69         * added #include <config.h> to all top-level source files
  70
  71 Sun Nov  8 20:40:28 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
  72
  73         * siman_tsp.c: clean up for make strict
  74
  75 1998-11-06    <bjg@ancho.lanl.gov>
  76
  77         * test.c: added prototype for memcpy using #include <string.h>
  78
  79         * siman_test.c: added prototype for memcpy using #include <string.h>
  80
  81 Wed Oct 28 15:06:58 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
  82
  83         * siman.c: added #include <string.h> for memcpy
  84
  85 Thu Aug 20 12:22:28 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
  86
  87         * siman.c: use (char *) judiciously to avoid warnings about void
  88         pointer arithmetic (see randist/shuffle.c for similar examples)
  89
  90         * siman_test.c: perform several tests, using the exact answer as
  91         the comparison value, rather than checking for stationarity.
  92
  93 Sun Jun 28 14:11:04 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
  94
  95         * Converted to work with rng-style random number generators
  96
  97         * gsl_siman.h: gsl_siman_step_t type functions now take a gsl_rng
  98         random number generator as their first argument
  99
 100         * siman.c (gsl_siman_solve): Now takes a gsl_rng random number
 101         generator as the first argument
 102
 103 Fri Jun 19 11:17:24 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
 104
 105         * siman.c (gsl_siman_solve_many): changed the variable 'throw' to
 106         'u' (for uniform-random-number) so that we can compile with c++
 107         where throw is a reserved word.
 108
 109 Sat May 23 13:59:55 1998  Brian Gough  <bjg@vvv.lanl.gov>
 110
 111         * siman.c: made the solving functions deterministic by removing
 112         the random seed, gsl_ran_seed(time(0L)). When the function is
 113         non-deterministic it is hard to debug and test (about 1 time in 20
 114         the test would fail due to the randomness). We can let the user do
 115         the seeding if they need that.
 116
 117 1998-02-09  Mark Galassi  <rosalia@nis.lanl.gov>
 118
 119         * siman_test_driver.sh (LAST_ENERGY): fixed a typo; the tests now
 120         report well when they converge.
 121
 122 1998-01-30  Mark Galassi  <rosalia@cygnus.com>
 123
 124         * siman_test_driver.sh, Makefile.am (TESTS): added a test driver
 125         so that now "make check" does something interesting.