Added MACS source
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / sort / sort.c
1 /*
2  * Implement Heap sort -- direct and indirect sorting
3  * Based on descriptions in Sedgewick "Algorithms in C"
4  *
5  * Copyright (C) 1999  Thomas Walter
6  *
7  * 18 February 2000: Modified for GSL by Brian Gough
8  *
9  * This is free software; you can redistribute it and/or modify it
10  * under the terms of the GNU General Public License as published by the
11  * Free Software Foundation; either version 3, or (at your option) any
12  * later version.
13  *
14  * This source is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
15  * ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
16  * FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License
17  * for more details.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <stdlib.h>
22 #include <gsl/gsl_heapsort.h>
23
24 static inline void swap (void *base, size_t size, size_t i, size_t j);
25 static inline void downheap (void *data, const size_t size, const size_t N, size_t k, gsl_comparison_fn_t compare);
26
27 /* Inline swap function for moving objects around */
28
29 static inline void
30 swap (void *base, size_t size, size_t i, size_t j)
31 {
32   register char *a = size * i + (char *) base;
33   register char *b = size * j + (char *) base;
34   register size_t s = size;
35
36   if (i == j)
37     return;
38
39   do
40     {
41       char tmp = *a;
42       *a++ = *b;
43       *b++ = tmp;
44     }
45   while (--s > 0);
46 }
47
48 #define CMP(data,size,j,k) (compare((char *)(data) + (size) * (j), (char *)(data) + (size) * (k)))
49
50 static inline void
51 downheap (void *data, const size_t size, const size_t N, size_t k, gsl_comparison_fn_t compare)
52 {
53   while (k <= N / 2)
54     {
55       size_t j = 2 * k;
56
57       if (j < N && CMP (data, size, j, j + 1) < 0)
58         {
59           j++;
60         }
61
62       if (CMP (data, size, k, j) < 0)
63         {
64           swap (data, size, j, k);
65         }
66       else
67         {
68           break;
69         }
70
71       k = j;
72     }
73 }
74
75 void
76 gsl_heapsort (void *data, size_t count, size_t size, gsl_comparison_fn_t compare)
77 {
78   /* Sort the array in ascending order. This is a true inplace
79      algorithm with N log N operations. Worst case (an already sorted
80      array) is something like 20% slower */
81
82   size_t N;
83   size_t k;
84
85   if (count == 0)
86     {
87       return;                   /* No data to sort */
88     }
89
90   /* We have n_data elements, last element is at 'n_data-1', first at
91      '0' Set N to the last element number. */
92
93   N = count - 1;
94
95   k = N / 2;
96   k++;                          /* Compensate the first use of 'k--' */
97   do
98     {
99       k--;
100       downheap (data, size, N, k, compare);
101     }
102   while (k > 0);
103
104   while (N > 0)
105     {
106       /* first swap the elements */
107       swap (data, size, 0, N);
108
109       /* then process the heap */
110       N--;
111
112       downheap (data, size, N, 0, compare);
113     }
114 }