Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / specfunc / hyperg.c
1 /* specfunc/hyperg.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000 Gerard Jungman
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 /* Author:  G. Jungman */
21
22 /* Miscellaneous implementations of use
23  * for evaluation of hypergeometric functions.
24  */
25 #include <config.h>
26 #include <gsl/gsl_math.h>
27 #include <gsl/gsl_errno.h>
28 #include <gsl/gsl_sf_exp.h>
29 #include <gsl/gsl_sf_gamma.h>
30
31 #include "error.h"
32 #include "hyperg.h"
33
34 #define SUM_LARGE  (1.0e-5*GSL_DBL_MAX)
35
36
37 int
38 gsl_sf_hyperg_1F1_series_e(const double a, const double b, const double x,
39                               gsl_sf_result * result
40                               )
41 {
42   double an  = a;
43   double bn  = b;
44   double n   = 1.0;
45   double del = 1.0;
46   double abs_del = 1.0;
47   double max_abs_del = 1.0;
48   double sum_val = 1.0;
49   double sum_err = 0.0;
50
51   while(abs_del/fabs(sum_val) > 0.25*GSL_DBL_EPSILON) {
52     double u, abs_u;
53
54     if(bn == 0.0) {
55       DOMAIN_ERROR(result);
56     }
57
58     if(an == 0.0) {
59       result->val  = sum_val;
60       result->err  = sum_err;
61       result->err += 2.0 * GSL_DBL_EPSILON * n * fabs(sum_val);
62       return GSL_SUCCESS;
63     }
64
65     if (n > 10000.0) {
66       result->val  = sum_val;
67       result->err  = sum_err;
68       GSL_ERROR ("hypergeometric series failed to converge", GSL_EFAILED);
69     }      
70
71     u = x * (an/(bn*n));
72     abs_u = fabs(u);
73     if(abs_u > 1.0 && max_abs_del > GSL_DBL_MAX/abs_u) {
74       result->val = sum_val;
75       result->err = fabs(sum_val);
76       GSL_ERROR ("overflow", GSL_EOVRFLW);
77     }
78     del *= u;
79     sum_val += del;
80     if(fabs(sum_val) > SUM_LARGE) {
81       result->val = sum_val;
82       result->err = fabs(sum_val);
83       GSL_ERROR ("overflow", GSL_EOVRFLW);
84     }
85
86     abs_del = fabs(del);
87     max_abs_del = GSL_MAX_DBL(abs_del, max_abs_del);
88     sum_err += 2.0*GSL_DBL_EPSILON*abs_del;
89
90     an += 1.0;
91     bn += 1.0;
92     n  += 1.0;
93   }
94
95   result->val  = sum_val;
96   result->err  = sum_err;
97   result->err += abs_del;
98   result->err += 2.0 * GSL_DBL_EPSILON * n * fabs(sum_val);
99
100   return GSL_SUCCESS;
101 }
102
103
104 int
105 gsl_sf_hyperg_1F1_large_b_e(const double a, const double b, const double x, gsl_sf_result * result)
106 {
107   if(fabs(x/b) < 1.0) {
108     const double u = x/b;
109     const double v = 1.0/(1.0-u);
110     const double pre = pow(v,a);
111     const double uv  = u*v;
112     const double uv2 = uv*uv;
113     const double t1  = a*(a+1.0)/(2.0*b)*uv2;
114     const double t2a = a*(a+1.0)/(24.0*b*b)*uv2;
115     const double t2b = 12.0 + 16.0*(a+2.0)*uv + 3.0*(a+2.0)*(a+3.0)*uv2;
116     const double t2  = t2a*t2b;
117     result->val  = pre * (1.0 - t1 + t2);
118     result->err  = pre * GSL_DBL_EPSILON * (1.0 + fabs(t1) + fabs(t2));
119     result->err += 2.0 * GSL_DBL_EPSILON * fabs(result->val);
120     return GSL_SUCCESS;
121   }
122   else {
123     DOMAIN_ERROR(result);
124   }
125 }
126
127
128 int
129 gsl_sf_hyperg_U_large_b_e(const double a, const double b, const double x,
130                              gsl_sf_result * result,
131                              double * ln_multiplier
132                              )
133 {
134   double N   = floor(b);  /* b = N + eps */
135   double eps = b - N;
136   
137   if(fabs(eps) < GSL_SQRT_DBL_EPSILON) {
138     double lnpre_val;
139     double lnpre_err;
140     gsl_sf_result M;
141     if(b > 1.0) {
142       double tmp = (1.0-b)*log(x);
143       gsl_sf_result lg_bm1;
144       gsl_sf_result lg_a;
145       gsl_sf_lngamma_e(b-1.0, &lg_bm1);
146       gsl_sf_lngamma_e(a, &lg_a);
147       lnpre_val = tmp + x + lg_bm1.val - lg_a.val;
148       lnpre_err = lg_bm1.err + lg_a.err + GSL_DBL_EPSILON * (fabs(x) + fabs(tmp));
149       gsl_sf_hyperg_1F1_large_b_e(1.0-a, 2.0-b, -x, &M);
150     }
151     else {
152       gsl_sf_result lg_1mb;
153       gsl_sf_result lg_1pamb;
154       gsl_sf_lngamma_e(1.0-b, &lg_1mb);
155       gsl_sf_lngamma_e(1.0+a-b, &lg_1pamb);
156       lnpre_val = lg_1mb.val - lg_1pamb.val;
157       lnpre_err = lg_1mb.err + lg_1pamb.err;
158       gsl_sf_hyperg_1F1_large_b_e(a, b, x, &M);
159     }
160
161     if(lnpre_val > GSL_LOG_DBL_MAX-10.0) {
162       result->val  = M.val;
163       result->err  = M.err;
164       *ln_multiplier = lnpre_val;
165       GSL_ERROR ("overflow", GSL_EOVRFLW);
166     }
167     else {
168       gsl_sf_result epre;
169       int stat_e = gsl_sf_exp_err_e(lnpre_val, lnpre_err, &epre);
170       result->val  = epre.val * M.val;
171       result->err  = epre.val * M.err + epre.err * fabs(M.val);
172       result->err += 2.0 * GSL_DBL_EPSILON * fabs(result->val);
173       *ln_multiplier = 0.0;
174       return stat_e;
175     }
176   }
177   else {
178     double omb_lnx = (1.0-b)*log(x);
179     gsl_sf_result lg_1mb;    double sgn_1mb;
180     gsl_sf_result lg_1pamb;  double sgn_1pamb;
181     gsl_sf_result lg_bm1;    double sgn_bm1;
182     gsl_sf_result lg_a;      double sgn_a;
183     gsl_sf_result M1, M2;
184     double lnpre1_val, lnpre2_val;
185     double lnpre1_err, lnpre2_err;
186     double sgpre1, sgpre2;
187     gsl_sf_hyperg_1F1_large_b_e(    a,     b, x, &M1);
188     gsl_sf_hyperg_1F1_large_b_e(1.0-a, 2.0-b, x, &M2);
189
190     gsl_sf_lngamma_sgn_e(1.0-b,   &lg_1mb,   &sgn_1mb);
191     gsl_sf_lngamma_sgn_e(1.0+a-b, &lg_1pamb, &sgn_1pamb);
192
193     gsl_sf_lngamma_sgn_e(b-1.0, &lg_bm1, &sgn_bm1);
194     gsl_sf_lngamma_sgn_e(a,     &lg_a,   &sgn_a);
195
196     lnpre1_val = lg_1mb.val - lg_1pamb.val;
197     lnpre1_err = lg_1mb.err + lg_1pamb.err;
198     lnpre2_val = lg_bm1.val - lg_a.val - omb_lnx - x;
199     lnpre2_err = lg_bm1.err + lg_a.err + GSL_DBL_EPSILON * (fabs(omb_lnx)+fabs(x));
200     sgpre1 = sgn_1mb * sgn_1pamb;
201     sgpre2 = sgn_bm1 * sgn_a;
202
203     if(lnpre1_val > GSL_LOG_DBL_MAX-10.0 || lnpre2_val > GSL_LOG_DBL_MAX-10.0) {
204       double max_lnpre_val = GSL_MAX(lnpre1_val,lnpre2_val);
205       double max_lnpre_err = GSL_MAX(lnpre1_err,lnpre2_err);
206       double lp1 = lnpre1_val - max_lnpre_val;
207       double lp2 = lnpre2_val - max_lnpre_val;
208       double t1  = sgpre1*exp(lp1);
209       double t2  = sgpre2*exp(lp2);
210       result->val  = t1*M1.val + t2*M2.val;
211       result->err  = fabs(t1)*M1.err + fabs(t2)*M2.err;
212       result->err += GSL_DBL_EPSILON * exp(max_lnpre_err) * (fabs(t1*M1.val) + fabs(t2*M2.val));
213       result->err += 2.0 * GSL_DBL_EPSILON * fabs(result->val);
214       *ln_multiplier = max_lnpre_val;
215       GSL_ERROR ("overflow", GSL_EOVRFLW);
216     }
217     else {
218       double t1 = sgpre1*exp(lnpre1_val);
219       double t2 = sgpre2*exp(lnpre2_val);
220       result->val  = t1*M1.val + t2*M2.val;
221       result->err  = fabs(t1) * M1.err + fabs(t2)*M2.err;
222       result->err += GSL_DBL_EPSILON * (exp(lnpre1_err)*fabs(t1*M1.val) + exp(lnpre2_err)*fabs(t2*M2.val));
223       result->err += 2.0 * GSL_DBL_EPSILON * fabs(result->val);
224       *ln_multiplier = 0.0;
225       return GSL_SUCCESS;
226     }
227   }
228 }
229
230
231
232 /* [Carlson, p.109] says the error in truncating this asymptotic series
233  * is less than the absolute value of the first neglected term.
234  *
235  * A termination argument is provided, so that the series will
236  * be summed at most up to n=n_trunc. If n_trunc is set negative,
237  * then the series is summed until it appears to start diverging.
238  */
239 int
240 gsl_sf_hyperg_2F0_series_e(const double a, const double b, const double x,
241                               int n_trunc,
242                               gsl_sf_result * result
243                               )
244 {
245   const int maxiter = 2000;
246   double an = a;
247   double bn = b;  
248   double n   = 1.0;
249   double sum = 1.0;
250   double del = 1.0;
251   double abs_del = 1.0;
252   double max_abs_del = 1.0;
253   double last_abs_del = 1.0;
254   
255   while(abs_del/fabs(sum) > GSL_DBL_EPSILON && n < maxiter) {
256
257     double u = an * (bn/n * x);
258     double abs_u = fabs(u);
259
260     if(abs_u > 1.0 && (max_abs_del > GSL_DBL_MAX/abs_u)) {
261       result->val = sum;
262       result->err = fabs(sum);
263       GSL_ERROR ("overflow", GSL_EOVRFLW);
264     }
265
266     del *= u;
267     sum += del;
268
269     abs_del = fabs(del);
270
271     if(abs_del > last_abs_del) break; /* series is probably starting to grow */
272
273     last_abs_del = abs_del;
274     max_abs_del  = GSL_MAX(abs_del, max_abs_del);
275
276     an += 1.0;
277     bn += 1.0;
278     n  += 1.0;
279     
280     if(an == 0.0 || bn == 0.0) break;        /* series terminated */
281     
282     if(n_trunc >= 0 && n >= n_trunc) break;  /* reached requested timeout */
283   }
284
285   result->val = sum;
286   result->err = GSL_DBL_EPSILON * n + abs_del;
287   if(n >= maxiter)
288     GSL_ERROR ("error", GSL_EMAXITER);
289   else
290     return GSL_SUCCESS;
291 }