htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/statistics/gsl_statistics_double.h

   1 /* statistics/gsl_statistics_double.h
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
   4  *
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   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
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  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18  */
  19
  20 #ifndef __GSL_STATISTICS_DOUBLE_H__
  21 #define __GSL_STATISTICS_DOUBLE_H__
  22
  23 #include <stddef.h>
  24
  25 #undef __BEGIN_DECLS
  26 #undef __END_DECLS
  27 #ifdef __cplusplus
  28 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
  29 # define __END_DECLS }
  30 #else
  31 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
  32 # define __END_DECLS /* empty */
  33 #endif
  34
  35 __BEGIN_DECLS
  36
  37 double gsl_stats_mean (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  38 double gsl_stats_variance (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  39 double gsl_stats_sd (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  40 double gsl_stats_variance_with_fixed_mean (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  41 double gsl_stats_sd_with_fixed_mean (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  42 double gsl_stats_tss (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  43 double gsl_stats_tss_m (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  44
  45 double gsl_stats_absdev (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  46 double gsl_stats_skew (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  47 double gsl_stats_kurtosis (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  48 double gsl_stats_lag1_autocorrelation (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  49
  50 double gsl_stats_covariance (const double data1[], const size_t stride1,const double data2[], const size_t stride2, const size_t n);
  51 double gsl_stats_correlation (const double data1[], const size_t stride1,const double data2[], const size_t stride2, const size_t n);
  52
  53 double gsl_stats_variance_m (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  54 double gsl_stats_sd_m (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  55 double gsl_stats_absdev_m (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  56 double gsl_stats_skew_m_sd (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
  57 double gsl_stats_kurtosis_m_sd (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
  58 double gsl_stats_lag1_autocorrelation_m (const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  59
  60 double gsl_stats_covariance_m (const double data1[], const size_t stride1,const double data2[], const size_t stride2, const size_t n, const double mean1, const double mean2);
  61
  62 /* DEFINED FOR FLOATING POINT TYPES ONLY */
  63
  64 double gsl_stats_wmean (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  65 double gsl_stats_wvariance (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  66 double gsl_stats_wsd (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  67 double gsl_stats_wvariance_with_fixed_mean (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  68 double gsl_stats_wsd_with_fixed_mean (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  69 double gsl_stats_wtss (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  70 double gsl_stats_wtss_m (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean);
  71 double gsl_stats_wabsdev (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  72 double gsl_stats_wskew (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  73 double gsl_stats_wkurtosis (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  74
  75 double gsl_stats_wvariance_m (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean);
  76 double gsl_stats_wsd_m (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean);
  77 double gsl_stats_wabsdev_m (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean);
  78 double gsl_stats_wskew_m_sd (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean, const double wsd);
  79 double gsl_stats_wkurtosis_m_sd (const double w[], const size_t wstride, const double data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean, const double wsd);
  80
  81 /* END OF FLOATING POINT TYPES */
  82
  83 double gsl_stats_pvariance (const double data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const double data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
  84 double gsl_stats_ttest (const double data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const double data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
  85
  86 double gsl_stats_max (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  87 double gsl_stats_min (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  88 void gsl_stats_minmax (double * min, double * max, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  89
  90 size_t gsl_stats_max_index (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  91 size_t gsl_stats_min_index (const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  92 void gsl_stats_minmax_index (size_t * min_index, size_t * max_index, const double data[], const size_t stride, const size_t n);
  93
  94 double gsl_stats_median_from_sorted_data (const double sorted_data[], const size_t stride, const size_t n) ;
  95 double gsl_stats_quantile_from_sorted_data (const double sorted_data[], const size_t stride, const size_t n, const double f) ;
  96
  97 __END_DECLS
  98
  99 #endif /* __GSL_STATISTICS_DOUBLE_H__ */