htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/statistics/gsl_statistics_short.h

   1 /* statistics/gsl_statistics_short.h
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
   7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
   8  * your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  13  * General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18  */
  19
  20 #ifndef __GSL_STATISTICS_SHORT_H__
  21 #define __GSL_STATISTICS_SHORT_H__
  22
  23 #include <stddef.h>
  24
  25 #undef __BEGIN_DECLS
  26 #undef __END_DECLS
  27 #ifdef __cplusplus
  28 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
  29 # define __END_DECLS }
  30 #else
  31 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
  32 # define __END_DECLS /* empty */
  33 #endif
  34
  35 __BEGIN_DECLS
  36
  37 double gsl_stats_short_mean (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  38 double gsl_stats_short_variance (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  39 double gsl_stats_short_sd (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  40 double gsl_stats_short_variance_with_fixed_mean (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  41 double gsl_stats_short_sd_with_fixed_mean (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  42 double gsl_stats_short_tss (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  43 double gsl_stats_short_tss_m (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  44
  45 double gsl_stats_short_absdev (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  46 double gsl_stats_short_skew (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  47 double gsl_stats_short_kurtosis (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  48 double gsl_stats_short_lag1_autocorrelation (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  49
  50 double gsl_stats_short_covariance (const short data1[], const size_t stride1,const short data2[], const size_t stride2, const size_t n);
  51 double gsl_stats_short_correlation (const short data1[], const size_t stride1,const short data2[], const size_t stride2, const size_t n);
  52
  53 double gsl_stats_short_variance_m (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  54 double gsl_stats_short_sd_m (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  55 double gsl_stats_short_absdev_m (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  56 double gsl_stats_short_skew_m_sd (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
  57 double gsl_stats_short_kurtosis_m_sd (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
  58 double gsl_stats_short_lag1_autocorrelation_m (const short data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  59
  60 double gsl_stats_short_covariance_m (const short data1[], const size_t stride1,const short data2[], const size_t stride2, const size_t n, const double mean1, const double mean2);
  61
  62
  63 double gsl_stats_short_pvariance (const short data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const short data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
  64 double gsl_stats_short_ttest (const short data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const short data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
  65
  66 short gsl_stats_short_max (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  67 short gsl_stats_short_min (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  68 void gsl_stats_short_minmax (short * min, short * max, const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  69
  70 size_t gsl_stats_short_max_index (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  71 size_t gsl_stats_short_min_index (const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  72 void gsl_stats_short_minmax_index (size_t * min_index, size_t * max_index, const short data[], const size_t stride, const size_t n);
  73
  74 double gsl_stats_short_median_from_sorted_data (const short sorted_data[], const size_t stride, const size_t n) ;
  75 double gsl_stats_short_quantile_from_sorted_data (const short sorted_data[], const size_t stride, const size_t n, const double f) ;
  76
  77 __END_DECLS
  78
  79 #endif /* __GSL_STATISTICS_SHORT_H__ */