htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/statistics/gsl_statistics_uint.h

   1 /* statistics/gsl_statistics_uint.h
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
   4  *
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   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
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  14  *
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  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
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  18  */
  19
  20 #ifndef __GSL_STATISTICS_UINT_H__
  21 #define __GSL_STATISTICS_UINT_H__
  22
  23 #include <stddef.h>
  24
  25 #undef __BEGIN_DECLS
  26 #undef __END_DECLS
  27 #ifdef __cplusplus
  28 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
  29 # define __END_DECLS }
  30 #else
  31 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
  32 # define __END_DECLS /* empty */
  33 #endif
  34
  35 __BEGIN_DECLS
  36
  37 double gsl_stats_uint_mean (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  38 double gsl_stats_uint_variance (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  39 double gsl_stats_uint_sd (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  40 double gsl_stats_uint_variance_with_fixed_mean (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  41 double gsl_stats_uint_sd_with_fixed_mean (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  42 double gsl_stats_uint_tss (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  43 double gsl_stats_uint_tss_m (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  44
  45 double gsl_stats_uint_absdev (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  46 double gsl_stats_uint_skew (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  47 double gsl_stats_uint_kurtosis (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  48 double gsl_stats_uint_lag1_autocorrelation (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  49
  50 double gsl_stats_uint_covariance (const unsigned int data1[], const size_t stride1,const unsigned int data2[], const size_t stride2, const size_t n);
  51 double gsl_stats_uint_correlation (const unsigned int data1[], const size_t stride1,const unsigned int data2[], const size_t stride2, const size_t n);
  52
  53 double gsl_stats_uint_variance_m (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  54 double gsl_stats_uint_sd_m (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  55 double gsl_stats_uint_absdev_m (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  56 double gsl_stats_uint_skew_m_sd (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
  57 double gsl_stats_uint_kurtosis_m_sd (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
  58 double gsl_stats_uint_lag1_autocorrelation_m (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
  59
  60 double gsl_stats_uint_covariance_m (const unsigned int data1[], const size_t stride1,const unsigned int data2[], const size_t stride2, const size_t n, const double mean1, const double mean2);
  61
  62
  63 double gsl_stats_uint_pvariance (const unsigned int data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const unsigned int data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
  64 double gsl_stats_uint_ttest (const unsigned int data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const unsigned int data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
  65
  66 unsigned int gsl_stats_uint_max (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  67 unsigned int gsl_stats_uint_min (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  68 void gsl_stats_uint_minmax (unsigned int * min, unsigned int * max, const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  69
  70 size_t gsl_stats_uint_max_index (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  71 size_t gsl_stats_uint_min_index (const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  72 void gsl_stats_uint_minmax_index (size_t * min_index, size_t * max_index, const unsigned int data[], const size_t stride, const size_t n);
  73
  74 double gsl_stats_uint_median_from_sorted_data (const unsigned int sorted_data[], const size_t stride, const size_t n) ;
  75 double gsl_stats_uint_quantile_from_sorted_data (const unsigned int sorted_data[], const size_t stride, const size_t n, const double f) ;
  76
  77 __END_DECLS
  78
  79 #endif /* __GSL_STATISTICS_UINT_H__ */