Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / statistics / gsl_statistics_ulong.h
1 /* statistics/gsl_statistics_ulong.h
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #ifndef __GSL_STATISTICS_ULONG_H__
21 #define __GSL_STATISTICS_ULONG_H__
22
23 #include <stddef.h>
24
25 #undef __BEGIN_DECLS
26 #undef __END_DECLS
27 #ifdef __cplusplus
28 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
29 # define __END_DECLS }
30 #else
31 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
32 # define __END_DECLS /* empty */
33 #endif
34
35 __BEGIN_DECLS
36
37 double gsl_stats_ulong_mean (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
38 double gsl_stats_ulong_variance (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
39 double gsl_stats_ulong_sd (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
40 double gsl_stats_ulong_variance_with_fixed_mean (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
41 double gsl_stats_ulong_sd_with_fixed_mean (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
42 double gsl_stats_ulong_tss (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
43 double gsl_stats_ulong_tss_m (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
44
45 double gsl_stats_ulong_absdev (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
46 double gsl_stats_ulong_skew (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
47 double gsl_stats_ulong_kurtosis (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
48 double gsl_stats_ulong_lag1_autocorrelation (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
49
50 double gsl_stats_ulong_covariance (const unsigned long data1[], const size_t stride1,const unsigned long data2[], const size_t stride2, const size_t n);
51 double gsl_stats_ulong_correlation (const unsigned long data1[], const size_t stride1,const unsigned long data2[], const size_t stride2, const size_t n);
52
53 double gsl_stats_ulong_variance_m (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
54 double gsl_stats_ulong_sd_m (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
55 double gsl_stats_ulong_absdev_m (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
56 double gsl_stats_ulong_skew_m_sd (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
57 double gsl_stats_ulong_kurtosis_m_sd (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean, const double sd);
58 double gsl_stats_ulong_lag1_autocorrelation_m (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n, const double mean);
59
60 double gsl_stats_ulong_covariance_m (const unsigned long data1[], const size_t stride1,const unsigned long data2[], const size_t stride2, const size_t n, const double mean1, const double mean2);
61
62
63 double gsl_stats_ulong_pvariance (const unsigned long data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const unsigned long data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
64 double gsl_stats_ulong_ttest (const unsigned long data1[], const size_t stride1, const size_t n1, const unsigned long data2[], const size_t stride2, const size_t n2);
65
66 unsigned long gsl_stats_ulong_max (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
67 unsigned long gsl_stats_ulong_min (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
68 void gsl_stats_ulong_minmax (unsigned long * min, unsigned long * max, const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
69
70 size_t gsl_stats_ulong_max_index (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
71 size_t gsl_stats_ulong_min_index (const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
72 void gsl_stats_ulong_minmax_index (size_t * min_index, size_t * max_index, const unsigned long data[], const size_t stride, const size_t n);
73
74 double gsl_stats_ulong_median_from_sorted_data (const unsigned long sorted_data[], const size_t stride, const size_t n) ;
75 double gsl_stats_ulong_quantile_from_sorted_data (const unsigned long sorted_data[], const size_t stride, const size_t n, const double f) ;
76
77 __END_DECLS
78
79 #endif /* __GSL_STATISTICS_ULONG_H__ */