htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/statistics/p_variance_source.c

   1 /* statistics/p_variance_source.c
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
   7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
   8  * your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  13  * General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18  */
  19
  20
  21 double
  22 FUNCTION(gsl_stats,pvariance) (const BASE data1[],
  23                                const size_t stride1, const size_t n1,
  24                                const BASE data2[],
  25                                const size_t stride2, const size_t n2)
  26 {
  27   /* Find the pooled variance of two datasets */
  28
  29   const double var1 = FUNCTION(gsl_stats,variance) (data1, stride1, n1);
  30   const double var2 = FUNCTION(gsl_stats,variance) (data2, stride2, n2);
  31
  32   /* calculate the pooled variance */
  33
  34   const double pooled_variance =
  35     (((n1 - 1) * var1) + ((n2 - 1) * var2)) / (n1 + n2 - 2);
  36
  37   return pooled_variance;
  38 }
  39