htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/statistics/wabsdev_source.c

   1 /* statistics/wabsdev_source.c
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
   7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
   8  * your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  13  * General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18  */
  19
  20 double
  21 FUNCTION(gsl_stats,wabsdev) (const BASE w[], const size_t wstride, const BASE data[], const size_t stride, const size_t n)
  22 {
  23   const double wmean = FUNCTION(gsl_stats,wmean)(w, wstride, data, stride, n);
  24   return FUNCTION(gsl_stats,wabsdev_m)(w, wstride, data, stride, n, wmean);
  25 }
  26
  27 double
  28 FUNCTION(gsl_stats,wabsdev_m) (const BASE w[], const size_t wstride, const BASE data[], const size_t stride, const size_t n, const double wmean)
  29 {
  30   /* Compute the weighted absolute deviation of a dataset */
  31
  32   long double wabsdev = 0;
  33   long double W = 0;
  34
  35   size_t i;
  36
  37   /* find the sum of the absolute deviations */
  38   for (i = 0; i < n; i++)
  39     {
  40       BASE wi = w[i * wstride];
  41
  42       if (wi > 0) {
  43         const long double delta = fabs(data[i * stride] - wmean);
  44         W += wi ;
  45         wabsdev += (delta - wabsdev) * (wi / W);
  46       }
  47     }
  48
  49   return wabsdev;
  50 }
  51