Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / statistics / wmean_source.c
1 /* statistics/wmean_source.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Jim Davies, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 double
21 FUNCTION (gsl_stats, wmean) (const BASE w[], const size_t wstride, const BASE data[], const size_t stride, const size_t size)
22 {
23   /* Compute the weighted arithmetic mean M of a dataset using the
24      recurrence relation
25
26      M(n) = M(n-1) + (data[n] - M(n-1)) (w(n)/(W(n-1) + w(n))) 
27      W(n) = W(n-1) + w(n)
28
29    */
30
31   long double wmean = 0;
32   long double W = 0;
33
34   size_t i;
35
36   for (i = 0; i < size; i++)
37     {
38       BASE wi = w[i * wstride];
39
40       if (wi > 0)
41         {
42           W += wi;
43           wmean += (data[i * stride] - wmean) * (wi / W);
44         }
45     }
46
47   return wmean;
48 }