Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / sum / levin_u.c
1 /* sum/levin_u.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Gerard Jungman, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <gsl/gsl_math.h>
22 #include <gsl/gsl_test.h>
23 #include <gsl/gsl_errno.h>
24 #include <gsl/gsl_sum.h>
25
26 int
27 gsl_sum_levin_u_accel (const double *array, const size_t array_size,
28                        gsl_sum_levin_u_workspace * w, 
29                        double *sum_accel, double *abserr)
30 {
31   return gsl_sum_levin_u_minmax (array, array_size,
32                                  0, array_size - 1, w, sum_accel, abserr);
33 }
34
35 int
36 gsl_sum_levin_u_minmax (const double *array, const size_t array_size,
37                         const size_t min_terms, const size_t max_terms,
38                         gsl_sum_levin_u_workspace * w,
39                         double *sum_accel, double *abserr)
40 {
41   if (array_size == 0)
42     {
43       *sum_accel = 0.0;
44       *abserr = 0.0;
45       w->sum_plain = 0.0;
46       w->terms_used = 0;
47       return GSL_SUCCESS;
48     }
49   else if (array_size == 1)
50     {
51       *sum_accel = array[0];
52       *abserr = 0.0;
53       w->sum_plain = array[0];
54       w->terms_used = 1;
55       return GSL_SUCCESS;
56     }
57   else
58     {
59       const double SMALL = 0.01;
60       const size_t nmax = GSL_MAX (max_terms, array_size) - 1;
61       double noise_n = 0.0, noise_nm1 = 0.0;
62       double trunc_n = 0.0, trunc_nm1 = 0.0;
63       double actual_trunc_n = 0.0, actual_trunc_nm1 = 0.0;
64       double result_n = 0.0, result_nm1 = 0.0;
65       double variance = 0;
66       size_t n;
67       unsigned int i;
68       int better = 0;
69       int before = 0;
70       int converging = 0;
71       double least_trunc = GSL_DBL_MAX;
72       double least_trunc_noise = GSL_DBL_MAX;
73       double least_trunc_result;
74
75       /* Calculate specified minimum number of terms.  No convergence
76          tests are made, and no truncation information is stored.  */
77
78       for (n = 0; n < min_terms; n++)
79         {
80           const double t = array[n];
81           result_nm1 = result_n;
82           gsl_sum_levin_u_step (t, n, nmax, w, &result_n);
83         }
84
85       least_trunc_result = result_n;
86
87       variance = 0;
88       for (i = 0; i < n; i++)
89         {
90           double dn = w->dsum[i] * GSL_MACH_EPS * array[i];
91           variance += dn * dn;
92         }
93       noise_n = sqrt (variance);
94
95       /* Calculate up to maximum number of terms.  Check truncation
96          condition.  */
97
98       for (; n <= nmax; n++)
99         {
100           const double t = array[n];
101
102           result_nm1 = result_n;
103           gsl_sum_levin_u_step (t, n, nmax, w, &result_n);
104
105           /* Compute the truncation error directly */
106
107           actual_trunc_nm1 = actual_trunc_n;
108           actual_trunc_n = fabs (result_n - result_nm1);
109
110           /* Average results to make a more reliable estimate of the
111              real truncation error */
112
113           trunc_nm1 = trunc_n;
114           trunc_n = 0.5 * (actual_trunc_n + actual_trunc_nm1);
115
116           noise_nm1 = noise_n;
117           variance = 0;
118
119           for (i = 0; i <= n; i++)
120             {
121               double dn = w->dsum[i] * GSL_MACH_EPS * array[i];
122               variance += dn * dn;
123             }
124
125           noise_n = sqrt (variance);
126
127           /* Determine if we are in the convergence region.  */
128
129           better = (trunc_n < trunc_nm1 || trunc_n < SMALL * fabs (result_n));
130           converging = converging || (better && before);
131           before = better;
132
133           if (converging)
134             {
135               if (trunc_n < least_trunc)
136                 {
137                   /* Found a low truncation point in the convergence
138                      region. Save it. */
139
140                   least_trunc_result = result_n;
141                   least_trunc = trunc_n;
142                   least_trunc_noise = noise_n;
143                 }
144
145               if (noise_n > trunc_n / 3.0)
146                 break;
147
148               if (trunc_n < 10.0 * GSL_MACH_EPS * fabs (result_n))
149                 break;
150             }
151
152         }
153
154       if (converging)
155         {
156           /* Stopped in the convergence region.  Return result and
157              error estimate.  */
158
159           *sum_accel = least_trunc_result;
160           *abserr = GSL_MAX_DBL (least_trunc, least_trunc_noise);
161           w->terms_used = n;
162           return GSL_SUCCESS;
163         }
164       else
165         {
166           /* Never reached the convergence region.  Use the last
167              calculated values.  */
168
169           *sum_accel = result_n;
170           *abserr = GSL_MAX_DBL (trunc_n, noise_n);
171           w->terms_used = n;
172           return GSL_SUCCESS;
173         }
174     }
175 }
176
177
178 int
179 gsl_sum_levin_u_step (const double term, const size_t n, const size_t nmax,
180                       gsl_sum_levin_u_workspace * w, double *sum_accel)
181 {
182
183 #define I(i,j) ((i)*(nmax+1) + (j))
184
185   if (n == 0)
186     {
187       *sum_accel = term;
188       w->sum_plain = term;
189
190       w->q_den[0] = 1.0 / term;
191       w->q_num[0] = 1.0;
192
193       w->dq_den[I (0, 0)] = -1.0 / (term * term);
194       w->dq_num[I (0, 0)] = 0.0;
195
196       w->dsum[0] = 1.0;
197
198       return GSL_SUCCESS;
199     }
200   else
201     {
202       double result;
203       double factor = 1.0;
204       double ratio = (double) n / (n + 1.0);
205       unsigned int i;
206       int j;
207
208       w->sum_plain += term;
209
210       w->q_den[n] = 1.0 / (term * (n + 1.0) * (n + 1.0));
211       w->q_num[n] = w->sum_plain * w->q_den[n];
212
213       for (i = 0; i < n; i++)
214         {
215           w->dq_den[I (i, n)] = 0;
216           w->dq_num[I (i, n)] = w->q_den[n];
217         }
218
219       w->dq_den[I (n, n)] = -w->q_den[n] / term;
220       w->dq_num[I (n, n)] =
221         w->q_den[n] + w->sum_plain * (w->dq_den[I (n, n)]);
222
223       for (j = n - 1; j >= 0; j--)
224         {
225           double c = factor * (j + 1) / (n + 1);
226           factor *= ratio;
227           w->q_den[j] = w->q_den[j + 1] - c * w->q_den[j];
228           w->q_num[j] = w->q_num[j + 1] - c * w->q_num[j];
229
230           for (i = 0; i < n; i++)
231             {
232               w->dq_den[I (i, j)] =
233                 w->dq_den[I (i, j + 1)] - c * w->dq_den[I (i, j)];
234               w->dq_num[I (i, j)] =
235                 w->dq_num[I (i, j + 1)] - c * w->dq_num[I (i, j)];
236             }
237
238           w->dq_den[I (n, j)] = w->dq_den[I (n, j + 1)];
239           w->dq_num[I (n, j)] = w->dq_num[I (n, j + 1)];
240         }
241
242       result = w->q_num[0] / w->q_den[0];
243
244       *sum_accel = result;
245
246       for (i = 0; i <= n; i++)
247         {
248           w->dsum[i] =
249             (w->dq_num[I (i, 0)] -
250              result * w->dq_den[I (i, 0)]) / w->q_den[0];
251         }
252
253       return GSL_SUCCESS;
254     }
255 }