htswanalysis/src/SRLib/chrom_list.h

   1 /* chrom_list:
   2  * Class used to store a mapping of chromosome name (as a string), to the corresponding file.
   3  */
   4
   5 #include <ext/hash_map>
   6
   7 #ifndef CHROMLIST_H
   8 #define CHROMLIST_H
   9
  10 using namespace std;
  11 using namespace __gnu_cxx;
  12
  13 struct eq_str {
  14   bool operator() (const string& a, const string& b) const {
  15     return(strcmp(a.c_str(), b.c_str()) == 0);
  16   }
  17 };
  18
  19 struct hash_str {
  20   size_t operator() (const string& a) const {
  21     hash<const char*> h;
  22     return(h(a.c_str()));
  23   }
  24 };
  25
  26 class ChromList : public hash_map<string, string, hash_str, eq_str> {
  27   public:
  28     ChromList(char* filename);
  29 };
  30
  31 #endif