htswanalysis/src/SRLib/loci.cpp

   1 #include <string>
   2 #include <iostream>
   3 #include "Loci.h"
   4
   5 using namespace std;
   6
   7 Loci::Loci(string chr, unsigned int pos) {
   8   this->chr = chr;
   9   this->pos = pos;
  10 }
  11
  12 Loci::Loci(const Loci& l) {
  13   this->chr = l.chr;
  14   this->pos = l.pos;
  15 }
  16
  17 Loci& Loci::operator=(const Loci& l) {
  18   if(this != &l) {
  19     this->chr = l.chr;
  20     this->pos = l.pos;
  21   }
  22   return *this;
  23 }
  24
  25 bool Loci::operator<(const Loci& a) const {
  26   return((this->chr == a.chr)?(this->pos < a.pos):(this->chr < a.chr));
  27 }
  28
  29 bool Loci::operator<=(const Loci& a) const {
  30   return((this->chr == a.chr)?(this->pos <= a.pos):(this->chr < a.chr));
  31 }
  32
  33 bool Loci::operator>=(const Loci& a) const {
  34   return((this->chr == a.chr)?(this->pos >= a.pos):(this->chr > a.chr));
  35 }
  36
  37 bool Loci::operator>(const Loci& a) const {
  38   return((this->chr == a.chr)?(this->pos > a.pos):(this->chr > a.chr));
  39 }
  40
  41
  42 ostream &operator<<( ostream &out, const Loci &h ) {
  43   out << h.chr << "\t" << h.pos;
  44   return out;
  45 }