htswanalysis/src/ValidationDesign/Read.h

   1 #include <vector>
   2 #include <string>
   3
   4 using namespace std;
   5
   6 #ifndef READ_H
   7 #define READ_H
   8
   9 class Read {
  10   public:
  11     string chr;
  12     unsigned int pos;
  13     bool strand;
  14
  15     Read(string chr, int pos, bool strand) { this->chr = chr; this->pos = pos; this->strand = strand; }
  16     Read(const Read& r) { this->chr = r.chr; this->pos = r.pos; this->strand = r.strand; }
  17     Read& operator=(const Read& r) {this->chr = r.chr; this->pos = r.pos; this->strand = r.strand; return *this;}
  18 };
  19
  20 typedef vector<Read> Reads;
  21
  22 #endif