htsworkflow/frontend/inventory/views.py

   1 from htsworkflow.frontend.inventory.models import Item, LongTermStorage
   2 from htsworkflow.frontend.experiments.models import FlowCell
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   4 from django.core.exceptions import ObjectDoesNotExist
   5 from django.http import HttpResponse
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   8 def link_flowcell_and_device(request, flowcell, serial):
   9     """
  10     Updates database records of a flowcell being archived on a device with a particular serial #
  11     """
  12     assert flowcell is not None
  13     assert serial is not None
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  15     ###########################################
  16     # Retrieve Storage Device
  17     try:
  18         sd = Item.objects.get(barcode_id=serial)
  19     except ObjectDoesNotExist, e:
  20         msg = "Item with barcode_id of %s not found." % (serial)
  21         raise ObjectDoesNotExist(msg)
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  23     ###########################################
  24     # Retrieve FlowCell
  25     try:
  26         fc = FlowCell.objects.get(flowcell_id=flowcell)
  27     except ObjectDoesNotExist, e:
  28         msg = "FlowCell with flowcell_id of %s not found." % (flowcell)
  29         raise ObjectDoesNotExist(msg)
  30
  31     ###########################################
  32     # Retrieve or create LongTermStorage Object
  33     count = fc.longtermstorage_set.count()
  34     lts = None
  35     if count > 1:
  36         msg = "There really should only be one longtermstorage object per flowcell"
  37         raise ValueError, msg
  38     elif count == 1:
  39         # lts already attached to flowcell
  40         lts = fc.longtermstorage_set.all()[0]
  41     else:
  42         lts = LongTermStorage()
  43         # Attach flowcell
  44         lts.flowcell = fc
  45         # Need a primary keey before linking to storage devices
  46         lts.save()
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  49     ############################################
  50     # Link Storage to Flowcell
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  52     # Add a link to this storage device if it is not already linked.
  53     if sd not in lts.storage_devices.values():
  54         lts.storage_devices.add(sd)
  55
  56     ###########################################
  57     # Add Library Links to LTS
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  59     if fc.lane_1_library not in lts.storage_devices.values():
  60         lts.libraries.add(fc.lane_1_library)
  61
  62     if fc.lane_2_library not in lts.storage_devices.values():
  63         lts.libraries.add(fc.lane_2_library)
  64
  65     if fc.lane_3_library not in lts.storage_devices.values():
  66         lts.libraries.add(fc.lane_3_library)
  67
  68     if fc.lane_4_library not in lts.storage_devices.values():
  69         lts.libraries.add(fc.lane_4_library)
  70
  71
  72     if fc.lane_5_library not in lts.storage_devices.values():
  73         lts.libraries.add(fc.lane_5_library)
  74
  75     if fc.lane_6_library not in lts.storage_devices.values():
  76         lts.libraries.add(fc.lane_6_library)
  77
  78     if fc.lane_7_library not in lts.storage_devices.values():
  79         lts.libraries.add(fc.lane_7_library)
  80
  81     if fc.lane_8_library not in lts.storage_devices.values():
  82         lts.libraries.add(fc.lane_8_library)
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  84     # Save Changes
  85     lts.save()
  86
  87     return HttpResponse("Success")