htsworkflow/frontend/samples/fixtures/initial_data.json

   1 [
   2   {
   3      "model": "samples.Cellline",
   4      "pk": 1,
   5      "fields": {
   6         "cellline_name": "Unknown",
   7         "notes": "Unknown"
   8      }
   9   },
  10   {
  11      "model": "samples.Cellline",
  12      "pk": 2,
  13      "fields": {
  14         "cellline_name": "C2C12 Exponential",
  15         "notes": ""
  16      }
  17   },
  18   {
  19      "model": "samples.Cellline",
  20      "pk": 3,
  21      "fields": {
  22         "cellline_name": "C2C12 60 hrs",
  23         "notes": "Unknown"
  24      }
  25   },
  26   {
  27      "model": "samples.LibraryType",
  28      "pk": 1,
  29      "fields": {
  30         "name": "Single End",
  31         "can_multiplex": false,
  32         "is_paired_end": false
  33      }
  34   },
  35   {
  36      "model": "samples.LibraryType",
  37      "pk": 2,
  38      "fields": {
  39         "name": "Paired End",
  40         "can_multiplex": false,
  41         "is_paired_end": true
  42      }
  43   },
  44   {
  45      "model": "samples.LibraryType",
  46      "pk": 5,
  47      "fields": {
  48         "name": "Barcoded",
  49         "can_multiplex": true,
  50         "is_paired_end": true
  51      }
  52   },
  53   {
  54      "model": "samples.ExperimentType",
  55      "pk": 1,
  56      "fields": {
  57         "name": "Unknown"
  58      }
  59   },
  60   {
  61      "model": "samples.ExperimentType",
  62      "pk": 2,
  63      "fields": {
  64         "name": "ChIP-seq"
  65      }
  66   },
  67   {
  68      "model": "samples.ExperimentType",
  69      "pk": 4,
  70      "fields": {
  71         "name": "RNA-seq"
  72      }
  73   },
  74   {
  75      "model": "samples.ExperimentType",
  76      "pk": 7,
  77      "fields": {
  78         "name": "De Novo"
  79      }
  80   },
  81   {
  82      "model": "samples.ExperimentType",
  83      "pk": 8,
  84      "fields": {
  85         "name": "Whole Genome"
  86      }
  87   },
  88   {
  89      "model": "samples.ExperimentType",
  90      "pk": 9,
  91      "fields": {
  92         "name": "Small RNA"
  93      }
  94   },
  95   {
  96      "model": "samples.ExperimentType",
  97      "pk": 10,
  98      "fields": {
  99         "name": "Multiplexed"
 100      }
 101   },
 102   {
 103      "model": "samples.Species",
 104      "pk": 2,
 105      "fields": {
 106         "scientific_name": "Drosophila melanogaster",
 107         "common_name": "fruit fly"
 108      }
 109   },
 110   {
 111      "model": "samples.Species",
 112      "pk": 3,
 113      "fields": {
 114         "scientific_name": "Caenorhabditis elegans",
 115         "common_name": ""
 116      }
 117   },
 118   {
 119      "model": "samples.Species",
 120      "pk": 6,
 121      "fields": {
 122         "scientific_name": "Arabidopsis thaliana"
 123      }
 124   },
 125   {
 126      "model": "samples.Species",
 127      "pk": 8,
 128      "fields": {
 129         "scientific_name": "Homo sapiens",
 130         "common_name": "human"
 131      }
 132   },
 133   {
 134      "model": "samples.Species",
 135      "pk": 9,
 136      "fields": {
 137         "scientific_name": "Mus musculus",
 138         "common_name": "mouse"
 139      }
 140   },
 141   {
 142      "model": "samples.Species",
 143      "pk": 10,
 144      "fields": {
 145         "scientific_name": "Strongylocentrotus purpuratus"
 146      }
 147   },
 148   {
 149     "pk": 1,
 150     "model": "samples.MultiplexIndex",
 151     "fields": {
 152       "multiplex_id": 1,
 153       "adapter_type": 8,
 154       "sequence": "ATCACG"
 155     }
 156   },
 157   {
 158     "pk": 2,
 159     "model": "samples.MultiplexIndex",
 160     "fields": {
 161       "multiplex_id": 2,
 162       "adapter_type": 8,
 163       "sequence": "CGATGT"
 164     }
 165   },
 166   {
 167     "pk": 3,
 168     "model": "samples.MultiplexIndex",
 169     "fields": {
 170       "multiplex_id": 3,
 171       "adapter_type": 8,
 172       "sequence": "TTAGGC"
 173     }
 174   },
 175   {
 176     "pk": 4,
 177     "model": "samples.MultiplexIndex",
 178     "fields": {
 179       "multiplex_id": 4,
 180       "adapter_type": 8,
 181       "sequence": "TGACCA"
 182     }
 183   },
 184   {
 185     "pk": 5,
 186     "model": "samples.MultiplexIndex",
 187     "fields": {
 188       "multiplex_id": 5,
 189       "adapter_type": 8,
 190       "sequence": "ACAGTG"
 191     }
 192   },
 193   {
 194     "pk": 6,
 195     "model": "samples.MultiplexIndex",
 196     "fields": {
 197       "multiplex_id": 6,
 198       "adapter_type": 8,
 199       "sequence": "GCCAAT"
 200     }
 201   },
 202   {
 203     "pk": 7,
 204     "model": "samples.MultiplexIndex",
 205     "fields": {
 206       "multiplex_id": 7,
 207       "adapter_type": 8,
 208       "sequence": "CAGATC"
 209     }
 210   },
 211   {
 212     "pk": 8,
 213     "model": "samples.MultiplexIndex",
 214     "fields": {
 215       "multiplex_id": 8,
 216       "adapter_type": 8,
 217       "sequence": "ACTTGA"
 218     }
 219   },
 220   {
 221     "pk": 9,
 222     "model": "samples.MultiplexIndex",
 223     "fields": {
 224       "multiplex_id": 9,
 225       "adapter_type": 8,
 226       "sequence": "GATCAG"
 227     }
 228   },
 229   {
 230     "pk": 10,
 231     "model": "samples.MultiplexIndex",
 232     "fields": {
 233       "multiplex_id": 10,
 234       "adapter_type": 8,
 235       "sequence": "TAGCTT"
 236     }
 237   },
 238   {
 239     "pk": 11,
 240     "model": "samples.MultiplexIndex",
 241     "fields": {
 242       "multiplex_id": 11,
 243       "adapter_type": 8,
 244       "sequence": "GGCTAC"
 245     }
 246   },
 247   {
 248     "pk": 12,
 249     "model": "samples.MultiplexIndex",
 250     "fields": {
 251       "multiplex_id": 12,
 252       "adapter_type": 8,
 253       "sequence": "CTTGTA"
 254     }
 255   },
 256   {
 257     "pk": 13,
 258     "model": "samples.MultiplexIndex",
 259     "fields": {
 260       "multiplex_id": 1,
 261       "adapter_type": 7,
 262       "sequence": "ATCACG"
 263     }
 264   },
 265   {
 266     "pk": 14,
 267     "model": "samples.MultiplexIndex",
 268     "fields": {
 269       "multiplex_id": 2,
 270       "adapter_type": 7,
 271       "sequence": "CGATGT"
 272     }
 273   },
 274   {
 275     "pk": 15,
 276     "model": "samples.MultiplexIndex",
 277     "fields": {
 278       "multiplex_id": 3,
 279       "adapter_type": 7,
 280       "sequence": "TTAGGC"
 281     }
 282   },
 283   {
 284     "pk": 16,
 285     "model": "samples.MultiplexIndex",
 286     "fields": {
 287       "multiplex_id": 4,
 288       "adapter_type": 7,
 289       "sequence": "TGACCA"
 290     }
 291   },
 292   {
 293     "pk": 17,
 294     "model": "samples.MultiplexIndex",
 295     "fields": {
 296       "multiplex_id": 5,
 297       "adapter_type": 7,
 298       "sequence": "ACAGTG"
 299     }
 300   },
 301   {
 302     "pk": 18,
 303     "model": "samples.MultiplexIndex",
 304     "fields": {
 305       "multiplex_id": 6,
 306       "adapter_type": 7,
 307       "sequence": "GCCAAT"
 308     }
 309   },
 310   {
 311     "pk": 19,
 312     "model": "samples.MultiplexIndex",
 313     "fields": {
 314       "multiplex_id": 7,
 315       "adapter_type": 7,
 316       "sequence": "CAGATC"
 317     }
 318   },
 319   {
 320     "pk": 20,
 321     "model": "samples.MultiplexIndex",
 322     "fields": {
 323       "multiplex_id": 8,
 324       "adapter_type": 7,
 325       "sequence": "ACTTGA"
 326     }
 327   },
 328   {
 329     "pk": 21,
 330     "model": "samples.MultiplexIndex",
 331     "fields": {
 332       "multiplex_id": 9,
 333       "adapter_type": 7,
 334       "sequence": "GATCAG"
 335     }
 336   },
 337   {
 338     "pk": 22,
 339     "model": "samples.MultiplexIndex",
 340     "fields": {
 341       "multiplex_id": 10,
 342       "adapter_type": 7,
 343       "sequence": "TAGCTT"
 344     }
 345   },
 346   {
 347     "pk": 23,
 348     "model": "samples.MultiplexIndex",
 349     "fields": {
 350       "multiplex_id": 11,
 351       "adapter_type": 7,
 352       "sequence": "GGCTAC"
 353     }
 354   },
 355   {
 356     "pk": 24,
 357     "model": "samples.MultiplexIndex",
 358     "fields": {
 359       "multiplex_id": 12,
 360       "adapter_type": 7,
 361       "sequence": "CTTGTA"
 362     }
 363   },
 364   {
 365     "pk": 25,
 366     "model": "samples.MultiplexIndex",
 367     "fields": {
 368       "multiplex_id": 13,
 369       "adapter_type": 7,
 370       "sequence": "AGTCAA"
 371     }
 372   },
 373   {
 374     "pk": 26,
 375     "model": "samples.MultiplexIndex",
 376     "fields": {
 377       "multiplex_id": 14,
 378       "adapter_type": 7,
 379       "sequence": "AGTTCC"
 380     }
 381   },
 382   {
 383     "pk": 27,
 384     "model": "samples.MultiplexIndex",
 385     "fields": {
 386       "multiplex_id": 15,
 387       "adapter_type": 7,
 388       "sequence": "ATGTCA"
 389     }
 390   },
 391   {
 392     "pk": 28,
 393     "model": "samples.MultiplexIndex",
 394     "fields": {
 395       "multiplex_id": 16,
 396       "adapter_type": 7,
 397       "sequence": "CCGTCC"
 398     }
 399   },
 400   {
 401     "pk": 29,
 402     "model": "samples.MultiplexIndex",
 403     "fields": {
 404       "multiplex_id": 17,
 405       "adapter_type": 7,
 406       "sequence": "GTAGAG"
 407     }
 408   },
 409   {
 410     "pk": 30,
 411     "model": "samples.MultiplexIndex",
 412     "fields": {
 413       "multiplex_id": 18,
 414       "adapter_type": 7,
 415       "sequence": "GTCCGC"
 416     }
 417   },
 418   {
 419     "pk": 31,
 420     "model": "samples.MultiplexIndex",
 421     "fields": {
 422       "multiplex_id": 19,
 423       "adapter_type": 7,
 424       "sequence": "GTGAAA"
 425     }
 426   },
 427   {
 428     "pk": 32,
 429     "model": "samples.MultiplexIndex",
 430     "fields": {
 431       "multiplex_id": 20,
 432       "adapter_type": 7,
 433       "sequence": "GTGGCC"
 434     }
 435   },
 436   {
 437     "pk": 33,
 438     "model": "samples.MultiplexIndex",
 439     "fields": {
 440       "multiplex_id": 21,
 441       "adapter_type": 7,
 442       "sequence": "GTTTCG"
 443     }
 444   },
 445   {
 446     "pk": 34,
 447     "model": "samples.MultiplexIndex",
 448     "fields": {
 449       "multiplex_id": 22,
 450       "adapter_type": 7,
 451       "sequence": "CGTACG"
 452     }
 453   },
 454   {
 455     "pk": 35,
 456     "model": "samples.MultiplexIndex",
 457     "fields": {
 458       "multiplex_id": 23,
 459       "adapter_type": 7,
 460       "sequence": "GAGTGG"
 461     }
 462   },
 463   {
 464     "pk": 36,
 465     "model": "samples.MultiplexIndex",
 466     "fields": {
 467       "multiplex_id": 24,
 468       "adapter_type": 7,
 469       "sequence": "GGTAGC"
 470     }
 471   },
 472   {
 473     "pk": 37,
 474     "model": "samples.MultiplexIndex",
 475     "fields": {
 476       "multiplex_id": 25,
 477       "adapter_type": 7,
 478       "sequence": "ACTGAT"
 479     }
 480   },
 481   {
 482     "pk": 38,
 483     "model": "samples.MultiplexIndex",
 484     "fields": {
 485       "multiplex_id": 26,
 486       "adapter_type": 7,
 487       "sequence": "ATGAGC"
 488     }
 489   },
 490   {
 491     "pk": 39,
 492     "model": "samples.MultiplexIndex",
 493     "fields": {
 494       "multiplex_id": 27,
 495       "adapter_type": 7,
 496       "sequence": "ATTCCT"
 497     }
 498   },
 499   {
 500     "pk": 40,
 501     "model": "samples.MultiplexIndex",
 502     "fields": {
 503       "multiplex_id": 28,
 504       "adapter_type": 7,
 505       "sequence": "CAAAAG"
 506     }
 507   },
 508   {
 509     "pk": 41,
 510     "model": "samples.MultiplexIndex",
 511     "fields": {
 512       "multiplex_id": 29,
 513       "adapter_type": 7,
 514       "sequence": "CAACTA"
 515     }
 516   },
 517   {
 518     "pk": 42,
 519     "model": "samples.MultiplexIndex",
 520     "fields": {
 521       "multiplex_id": 30,
 522       "adapter_type": 7,
 523       "sequence": "CACCGG"
 524     }
 525   },
 526   {
 527     "pk": 43,
 528     "model": "samples.MultiplexIndex",
 529     "fields": {
 530       "multiplex_id": 31,
 531       "adapter_type": 7,
 532       "sequence": "CACGAT"
 533     }
 534   },
 535   {
 536     "pk": 44,
 537     "model": "samples.MultiplexIndex",
 538     "fields": {
 539       "multiplex_id": 32,
 540       "adapter_type": 7,
 541       "sequence": "CACTCA"
 542     }
 543   },
 544   {
 545     "pk": 45,
 546     "model": "samples.MultiplexIndex",
 547     "fields": {
 548       "multiplex_id": 33,
 549       "adapter_type": 7,
 550       "sequence": "CAGGCG"
 551     }
 552   },
 553   {
 554     "pk": 46,
 555     "model": "samples.MultiplexIndex",
 556     "fields": {
 557       "multiplex_id": 34,
 558       "adapter_type": 7,
 559       "sequence": "CATGGC"
 560     }
 561   },
 562   {
 563     "pk": 47,
 564     "model": "samples.MultiplexIndex",
 565     "fields": {
 566       "multiplex_id": 35,
 567       "adapter_type": 7,
 568       "sequence": "CATTTT"
 569     }
 570   },
 571   {
 572     "pk": 48,
 573     "model": "samples.MultiplexIndex",
 574     "fields": {
 575       "multiplex_id": 36,
 576       "adapter_type": 7,
 577       "sequence": "CCAACA"
 578     }
 579   },
 580   {
 581     "pk": 49,
 582     "model": "samples.MultiplexIndex",
 583     "fields": {
 584       "multiplex_id": 37,
 585       "adapter_type": 7,
 586       "sequence": "CGGAAT"
 587     }
 588   },
 589   {
 590     "pk": 50,
 591     "model": "samples.MultiplexIndex",
 592     "fields": {
 593       "multiplex_id": 38,
 594       "adapter_type": 7,
 595       "sequence": "CTAGCT"
 596     }
 597   },
 598   {
 599     "pk": 51,
 600     "model": "samples.MultiplexIndex",
 601     "fields": {
 602       "multiplex_id": 39,
 603       "adapter_type": 7,
 604       "sequence": "CTATAC"
 605     }
 606   },
 607   {
 608     "pk": 52,
 609     "model": "samples.MultiplexIndex",
 610     "fields": {
 611       "multiplex_id": 40,
 612       "adapter_type": 7,
 613       "sequence": "CTCAGA"
 614     }
 615   },
 616   {
 617     "pk": 53,
 618     "model": "samples.MultiplexIndex",
 619     "fields": {
 620       "multiplex_id": 41,
 621       "adapter_type": 7,
 622       "sequence": "GACGAC"
 623     }
 624   },
 625   {
 626     "pk": 54,
 627     "model": "samples.MultiplexIndex",
 628     "fields": {
 629       "multiplex_id": 42,
 630       "adapter_type": 7,
 631       "sequence": "TAATCG"
 632     }
 633   },
 634   {
 635     "pk": 55,
 636     "model": "samples.MultiplexIndex",
 637     "fields": {
 638       "multiplex_id": 43,
 639       "adapter_type": 7,
 640       "sequence": "TACAGC"
 641     }
 642   },
 643   {
 644     "pk": 56,
 645     "model": "samples.MultiplexIndex",
 646     "fields": {
 647       "multiplex_id": 44,
 648       "adapter_type": 7,
 649       "sequence": "TATAAT"
 650     }
 651   },
 652   {
 653     "pk": 57,
 654     "model": "samples.MultiplexIndex",
 655     "fields": {
 656       "multiplex_id": 45,
 657       "adapter_type": 7,
 658       "sequence": "TCATTC"
 659     }
 660   },
 661   {
 662     "pk": 58,
 663     "model": "samples.MultiplexIndex",
 664     "fields": {
 665       "multiplex_id": 46,
 666       "adapter_type": 7,
 667       "sequence": "TCCCGA"
 668     }
 669   },
 670   {
 671     "pk": 59,
 672     "model": "samples.MultiplexIndex",
 673     "fields": {
 674       "multiplex_id": 47,
 675       "adapter_type": 7,
 676       "sequence": "TCGAAG"
 677     }
 678   },
 679   {
 680     "pk": 60,
 681     "model": "samples.MultiplexIndex",
 682     "fields": {
 683       "multiplex_id": 48,
 684       "adapter_type": 7,
 685       "sequence": "TCGGCA"
 686     }
 687   },
 688   {
 689     "pk": 61,
 690     "model": "samples.MultiplexIndex",
 691     "fields": {
 692       "multiplex_id": 1,
 693       "adapter_type": 5,
 694       "sequence": "ATCACG"
 695     }
 696   },
 697   {
 698     "pk": 62,
 699     "model": "samples.MultiplexIndex",
 700     "fields": {
 701       "multiplex_id": 2,
 702       "adapter_type": 5,
 703       "sequence": "CGATGT"
 704     }
 705   },
 706   {
 707     "pk": 63,
 708     "model": "samples.MultiplexIndex",
 709     "fields": {
 710       "multiplex_id": 3,
 711       "adapter_type": 5,
 712       "sequence": "TTAGGC"
 713     }
 714   },
 715   {
 716     "pk": 64,
 717     "model": "samples.MultiplexIndex",
 718     "fields": {
 719       "multiplex_id": 4,
 720       "adapter_type": 5,
 721       "sequence": "TGACCA"
 722     }
 723   },
 724   {
 725     "pk": 65,
 726     "model": "samples.MultiplexIndex",
 727     "fields": {
 728       "multiplex_id": 5,
 729       "adapter_type": 5,
 730       "sequence": "ACAGTG"
 731     }
 732   },
 733   {
 734     "pk": 66,
 735     "model": "samples.MultiplexIndex",
 736     "fields": {
 737       "multiplex_id": 6,
 738       "adapter_type": 5,
 739       "sequence": "GCCAAT"
 740     }
 741   },
 742   {
 743     "pk": 67,
 744     "model": "samples.MultiplexIndex",
 745     "fields": {
 746       "multiplex_id": 7,
 747       "adapter_type": 5,
 748       "sequence": "CAGATC"
 749     }
 750   },
 751   {
 752     "pk": 68,
 753     "model": "samples.MultiplexIndex",
 754     "fields": {
 755       "multiplex_id": 8,
 756       "adapter_type": 5,
 757       "sequence": "ACTTGA"
 758     }
 759   },
 760   {
 761     "pk": 69,
 762     "model": "samples.MultiplexIndex",
 763     "fields": {
 764       "multiplex_id": 9,
 765       "adapter_type": 5,
 766       "sequence": "GATCAG"
 767     }
 768   },
 769   {
 770     "pk": 70,
 771     "model": "samples.MultiplexIndex",
 772     "fields": {
 773       "multiplex_id": 10,
 774       "adapter_type": 5,
 775       "sequence": "TAGCTT"
 776     }
 777   },
 778   {
 779     "pk": 71,
 780     "model": "samples.MultiplexIndex",
 781     "fields": {
 782       "multiplex_id": 11,
 783       "adapter_type": 5,
 784       "sequence": "GGCTAC"
 785     }
 786   },
 787   {
 788     "pk": 72,
 789     "model": "samples.MultiplexIndex",
 790     "fields": {
 791       "multiplex_id": 12,
 792       "adapter_type": 5,
 793       "sequence": "CTTGTA"
 794     }
 795   }
 796 ]