htsworkflow/frontend/templates/experiments/started_email.txt

   1 The following libraries are on the flowcell {{ flowcell.flowcell_id }}
   2 which is a {{ flowcell.read_length }} base pair {% if flowcell.paired_end %}paired end{% else %}single ended{% endif %} flowcell.
   3
   4 Lane : (Library Id) Library Name (Cluster Estimate)
   5 {% for lane in lanes %}
   6 Lane #{{ lane.lane_number }} : ({{ lane.library.id }}) {{ lane.library.library_name }} ({{ lane.cluster_estimate }})
   7      http://jumpgate.caltech.edu/library/{{ lane.library.id }}
   8 {% endfor %}
   9
  10 The raw data should be available at the following link when
  11 the pipeline finishes, probably in about
  12 {{ finish_low.days }} to {{ finish_high.days }} days after the flowcell is started.
  13
  14 http://jumpgate.caltech.edu/runfolders/cellcenter/
  15
  16 - Jumpgate