htsworkflow/pipelines/test/testdata/casava_1.7_export.txt

   1 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2112    1040    0       1       CCNCATCTCAAAGAAGTNNNNNNNCNNNAAGTTTAATG  \ZBZ^]]]]W__a_BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
   2 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2130    1046    0       1       CTAGACCTGCAGGTGAGCNNGGTGGCCTATACATAGGC  ^Z]PXG^^[Q^BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  3:0:0                                                                                   N
   3 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2181    1040    0       1       CTNGGCTCTGGTATTTANNNNNNNTNNNTATTACATGG  \LBSQ[T]XQY__BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
   4 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2220    1045    0       1       GTGTTGTTGCCATGGTAANNCTGCTCAGTACGAGAGGA  ``````````_____UXUBBX]YXX`T```____T___  2:0:0                                                                                   N
   5 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2398    1045    0       1       CCACCAACTAAGCTTGGCNNTCCACCACCACCCACGGA  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  NM                                                                                      N
   6 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2537    1044    0       1       GACTCCCTCTCCATCGCCNNCGNGCCGCCTGGCCCATC  ^H[^BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
   7 ILLUMINA-33A494 1       1       1       2678    1045    0       1       AAGGTGAAGAAGGAGATGNNGATGATGACGACGATAGA  ]]WW[[W]W]]R\WWZ[RBBS^\XVa____]W[]]___  chrX.fa         148341829       F       18AA15G1T       45                                              N
   8 ILLUMINA-33A494 1       1       1       3023    1046    0       1       AGGCTCTGCCCAGCCCCGNNGAGGCCGCCGCCGCCGCC  ```````````````[R^BBWZXPU_a___````````  chr7.fa         148513191       R       18AT18  117                                             N
   9 ILLUMINA-33A494 1       1       1       3458    1037    0       1       GGNNGCTTGTTGGTGGANNNNNNNTNNNCTTCNNGGAC  ]\BB][^^^[`````BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
  10 ILLUMINA-33A494 1       1       1       3577    1045    0       1       CCGCGTCCAACCCCAACCNNTGCTTGTTGTCATAAACT  ```````````````^]^BB^^[^^`````````````  chr2.fa         126187548       F       18GC18  117                                             N
  11 ILLUMINA-33A494 1       1       1       3615    1038    0       1       ATNNGATCCACTCTCTCNNNNNNNCNNNAAACNNAATC  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
  12 ILLUMINA-33A494 1       1       1       3710    1045    0       1       CAAAGACCTTGTCATCGCNNGGTAACACAAGTCCCTTG  ```````````````\ZZBB][TYV_________a___  chr19.fa                12878540        F       18AG18  117                                             N
  13 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4021    1037    0       1       GGNNGCGGGTCGTGATGNNNNNNNANNNCAACNNTCCT  [[BBSV[ZUS___aBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
  14 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4071    1045    0       1       TGAGGGAAGAATGTTATGNNTACTCCTACGAATATGAT  ```````````````[^^BB^^Z^X`````````````  2:1:0                                                                                   N
  15 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4138    1036    0       1       AGNNTCACAGCTTGTTGNNNNNNNTNNNTGTTNNAGCT  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
  16 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4349    1045    0       1       CTGTGAGCAGTAGTGGCTNNTGTTATGTCAACATAGGG  aX__a___a_aa___ZZ\BBZV[YHUU[[\aX___X^^  chr6.fa         35461795        R       18GC18  116                                             N
  17 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4372    1040    0       1       GANGTGTAGTAGGCAGANNNNNNNGNNNACTGGAGCTG  ]LB]VZSP]P_____BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  QC                                                                                      N
  18 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4405    1046    0       1       GTGGTTTCGCTGGATAGTNNGTAGGGACAGTGGGAATC  ``````````__a__V^XBB^SW^^a_____a______  9:2:0                                                                                   N
  19 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4859    1045    0       1       CATTATTGTTATACCAAANNTCATATCCTATAATCTGG  a_XX_[[__^`````^^^BB^\^SZ`````____a^__  Lambda_1-1_11936nts.fa          11716   F       18TG18  117                                             N
  20 ILLUMINA-33A494 1       1       1       4900    1043    0       1       AAAACCCCTTGTTTTATANNGANTTTNATCTTATTACC  MU[OXUXMZZ^]^U^OOOBBWPBVWTBOVVZZ^Z^```  QC                                                                                      N
  21 ILLUMINA-33A494 1       1       1       5046    1046    0       1       AGTCGGTTGTAATGATACNNAACTCCAGGACACCAGTG  ___a______````_Y[ZBB^^^^^`````````````  chr10.fa                85365712        F       CA16AG18        46                                              N
  22 ILLUMINA-33A494 1       1       1       5811    1045    0       1       GGGCTACTAAGGTGAACANNCGACTTCTTGTGAAGGGT  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB  NM                                                                                      N
  23 ILLUMINA-33A494 1       1       1       5939    1046    0       1       AAGACAGGATGTCTGTGTNNAATTGAACCTCTCTTGCC  ```````````````][]BBZ\\Z]`````````````  chr7.fa         75376418        F       18AA18  117                                             N
  24 ILLUMINA-33A494 1       1       1       5939    1046    0       1       AAGACAGGATGTCTGTGTAAAATTGAACCTCTCTTGCC  ```````````````][]BBZ\\Z]`````````````  chr7.fa         75376418        F       36      117                                             N
  25 ILLUMINA-33A494 1       1       1       6641    1046    0       1       CATAAGGAAGTAGGTTTCNNAGAAACAGACCCCACTGG  `````__I_____W_][[BBVYXYX`````````[[__  chr7.fa         148154014       F       18TG18  36                                              N
  26 ILLUMINA-33A494 1       1       1       11929   1046    0       1       GGGAATGCTATATCTGGGNNTCCGATTATTAGTGGGAC  ```````````````^^^BB^]\^X``````````___  2:0:0                                                                                   N
  27 ILLUMINA-33A494 1       1       1       12291   1046    0       1       CCGAAGTGGAGAAGGGTTNNATGTGAACAGCAGTTGAA  a____a_________^X^BBZ^ZX[_a_______aa__  2:0:1                                                                                   N
  28 ILLUMINA-33A494 1       1       1       13612   1047    0       1       AGGAGGACGAGGACACAGNNCTGGTAGACATGGCTTCG  X`````````____aXZSBB[ZZZPX]]\]`````___  chr2.fa         13496052        R       18AC18  117                                             N