htsworkflow/util/rdfns.py

   1 """Namespace definitions
   2
   3 All in one place to make import rdfns.* work safely
   4 """
   5 from RDF import NS
   6
   7 # standard ontology namespaces
   8 rdfNS = NS("http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#")
   9 rdfsNS = NS("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#")
  10 owlNS = NS('http://www.w3.org/2002/07/owl#')
  11 dcNS = NS("http://purl.org/dc/elements/1.1/")
  12 xmlNS = NS('http://www.w3.org/XML/1998/namespace')
  13 xsdNS = NS("http://www.w3.org/2001/XMLSchema#")
  14 vsNS = NS('http://www.w3.org/2003/06/sw-vocab-status/ns#')
  15 wotNS = NS('http://xmlns.com/wot/0.1/')
  16
  17 # internal ontologies
  18 submissionOntology = NS(
  19     "http://jumpgate.caltech.edu/wiki/UcscSubmissionOntology#")
  20 dafTermOntology = NS("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/UcscDaf#")
  21 libraryOntology = NS("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/LibraryOntology#")
  22 inventoryOntology = NS(
  23     "http://jumpgate.caltech.edu/wiki/InventoryOntology#")
  24 submissionLog = NS("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/SubmissionsLog/")
  25 geoSoftNS = NS('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/soft2.html#')
  26 encode3NS = NS("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/Encode3#")