htsworkflow/util/rdfns.py

   1 """Namespace definitions
   2
   3 All in one place to make import rdfns.* work safely
   4 """
   5 from rdflib import Namespace
   6 from rdflib.namespace  import (DC, RDF, RDFS, OWL, XMLNS, XSD)
   7
   8 # standard ontology namespaces
   9 VS = Namespace('http://www.w3.org/2003/06/sw-vocab-status/ns#')
  10 WOT = Namespace('http://xmlns.com/wot/0.1/')
  11
  12 # internal ontologies
  13 submissionOntology = Namespace(
  14     "http://jumpgate.caltech.edu/wiki/UcscSubmissionOntology#")
  15 dafTermOntology = Namespace("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/UcscDaf#")
  16 libraryOntology = Namespace("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/LibraryOntology#")
  17 inventoryOntology = Namespace(
  18     "http://jumpgate.caltech.edu/wiki/InventoryOntology#")
  19 submissionLog = Namespace("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/SubmissionsLog/")
  20 geoSoftNS = Namespace('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/soft2.html#')
  21 encode3NS = Namespace("http://jumpgate.caltech.edu/wiki/Encode3#")