scripts/retrieve_config

   1 #!/usr/bin/env python
   2 import sys
   3 from gaworkflow.pipeline.retrieve_config import *
   4
   5 def main(args=None):
   6   #Display help if no args are presented
   7   if len(sys.argv) == 1:
   8     sys.argv.append('-h')
   9
  10   options = getCombinedOptions()
  11   msg_list = ['ERROR MESSAGES:']
  12   if options.output_filepath is None:
  13     msg_list.append("  Output filepath argument required. -o <filepath> or --output=<filepath>")
  14
  15   if options.flowcell is None:
  16     msg_list.append("  Flow cell argument required. -f <flowcell> or --flowcell=<flowcell>")
  17
  18   if options.url is None:
  19     msg_list.append("  URL argument required (-u <url> or --url=<url>), or entry\n" \
  20                     "    in /etc/ga_frontend/ga_frontend.conf or ~/.ga_frontend.conf")
  21
  22   if len(msg_list) > 1:
  23     print '\n'.join(msg_list)
  24     return 1
  25
  26   saveConfigFile(options.flowcell, options.url, options.output_filepath)
  27   return 0
  28
  29 if __name__ == "__main__":
  30   sys.exit(main(sys.argv[1:]))