Recent IPAR xml config blocks include the runfolder name
[htsworkflow.git] / htsworkflow / pipelines /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 425 __init__.py
-rw-r--r-- 17203 bustard.py
-rw-r--r-- 18158 configure_run.py
-rw-r--r-- 2794 desplit_fastq.py
-rw-r--r-- 31561 eland.py
-rw-r--r-- 5073 firecrest.py
-rw-r--r-- 3736 genome_mapper.py
-rw-r--r-- 3113 genomemap.py
-rw-r--r-- 16748 gerald.py
-rw-r--r-- 8129 ipar.py
-rw-r--r-- 6632 qseq2fastq.py
-rw-r--r-- 1000 recipe_parser.py
-rw-r--r-- 14822 retrieve_config.py
-rw-r--r-- 13172 run_status.py
-rw-r--r-- 30985 runfolder.py
-rw-r--r-- 2361 samplekey.py
-rw-r--r-- 18469 sequences.py
-rw-r--r-- 7030 srf.py
-rw-r--r-- 7841 srf2fastq.py
-rw-r--r-- 18130 summary.py
drwxr-xr-x - test