alg/test/test_glsequence.cxx

   1 #include <boost/test/auto_unit_test.hpp>
   2
   3 #include <string>
   4
   5 #include "alg/glsequence.h"
   6 #include "alg/sequence.hh"
   7
   8 using namespace std;
   9
  10 BOOST_AUTO_TEST_CASE ( glsequence_operator_equal )
  11 {
  12   // I don't trust my operator = hack so lets make sure it works.
  13   string s0("AAGGCCTT");
  14   string s1("TTGGCCAA");
  15   Sequence seq0(s0);
  16   Sequence seq1(s1);
  17
  18   GlSequence glseq0(seq0);
  19   BOOST_CHECK (glseq0.sequence().get_seq() == s0);
  20   // width of a sequence should be number of base pairs (aka chars)
  21   BOOST_CHECK (glseq0.width() == s0.size());
  22   GlSequence glseq1(seq1);
  23   GlSequence glseq_copy0(glseq0);
  24
  25   BOOST_CHECK(glseq_copy0.sequence().get_seq() == glseq0.sequence().get_seq());
  26   BOOST_CHECK( &(glseq_copy0.sequence()) == &(glseq0.sequence()));
  27
  28   glseq0 = glseq1;
  29
  30   BOOST_CHECK( glseq0.sequence().get_seq() == s1 );
  31 }