alg/test/test_sequence_location.cpp

   1 #define BOOST_AUTO_TEST_MAIN
   2 #include <boost/test/auto_unit_test.hpp>
   3
   4 #include "alg/sequence_location.hpp"
   5 #include "alg/sequence.hpp"
   6
   7 BOOST_AUTO_TEST_CASE( basic_sequence_location )
   8 {
   9   Sequence s("AAGGCCTT");
  10
  11   SequenceLocation sl(s, 0, 2);
  12
  13   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getLeft(), 0 );
  14   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getRight(), 2 );
  15   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getCount(), 2 );
  16
  17   sl.setLeft(1);
  18   sl.setRight(3);
  19
  20   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getLeft(), 1 );
  21   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getRight(), 3 );
  22   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getCount(), 2 );
  23 }
  24
  25 BOOST_AUTO_TEST_CASE( memory_test )
  26 {
  27   SequenceLocation *sl;
  28   // storing references is a bad idea
  29   {
  30     Sequence s("AAGGCCTT");
  31     sl = new SequenceLocation(s, 0, 2);
  32   }
  33
  34   BOOST_CHECK_EQUAL(sl->getSequence(), "AAGGCCTT");
  35   BOOST_CHECK_EQUAL(sl->getSelectedSequence(), "AA");
  36 }