gui/SeqTextWindow.cpp

   1 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   2 //  http://mussa.caltech.edu/
   3 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   4
   5 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   6 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
   7 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
   8 // file for more information, or contact Tristan directly.
   9
  10
  11 #include "gui/SeqTextWindow.hpp"
  12
  13 #include <iostream>
  14 using namespace std;
  15 void
  16 get_seq_cb(Fl_Button* o, void* v)
  17 {
  18   SeqTextWindow* T=(SeqTextWindow*)v;
  19   T->real_get_seq_cb();
  20 }
  21
  22 void
  23 SeqTextWindow::real_get_seq_cb()
  24 {
  25   string sub_seq_formatted;
  26   int seq_len, i, line_len;
  27
  28
  29   cout << "length = " << seq_end-seq_start << endl;
  30
  31   // make sure inputed values within valid ranges
  32   if ((seq_end > seq_start) && (seq_id > -1) && (seq_id < the_seqs.size()) )
  33   {
  34     sub_sequence = the_seqs[seq_id].subseq(seq_start, seq_end-seq_start);
  35
  36     sub_seq_formatted = "";
  37     seq_len = sub_sequence.size();
  38     line_len = 40;
  39     for (i = 0; i < seq_len; i += line_len)
  40     {
  41       sub_seq_formatted.append(sub_sequence.substr(i,line_len));
  42       sub_seq_formatted.append("\n");
  43     }
  44
  45     seq_display->value((const char *)sub_seq_formatted.c_str());
  46   }
  47 }
  48
  49
  50 // *** input seq index id
  51
  52 void
  53 set_seq_id_cb(Fl_Input* o, void* v)
  54 {
  55   SeqTextWindow* T=(SeqTextWindow*)v;
  56   T->real_set_seq_id_cb(o);
  57 }
  58
  59 void
  60 SeqTextWindow::real_set_seq_id_cb(Fl_Input* o)
  61 {
  62   seq_id = atoi(o->value()) - 1;   // -1 since arrays start at 0
  63 }
  64
  65
  66 // *** input seq start index
  67
  68 void
  69 set_seq_start_cb(Fl_Input* o, void* v)
  70 {
  71   SeqTextWindow* T=(SeqTextWindow*)v;
  72   T->real_set_seq_start_cb(o);
  73 }
  74
  75 void
  76 SeqTextWindow::real_set_seq_start_cb(Fl_Input* o)
  77 {
  78   seq_start = atoi(o->value());
  79 }
  80
  81 // *** input seq end index
  82
  83 void
  84 set_seq_end_cb(Fl_Input* o, void* v)
  85 {
  86   SeqTextWindow* T=(SeqTextWindow*)v;
  87   T->real_set_seq_end_cb(o);
  88 }
  89
  90 void
  91 SeqTextWindow::real_set_seq_end_cb(Fl_Input* o)
  92 {
  93   seq_end = atoi(o->value());
  94 }
  95
  96
  97 SeqTextWindow::SeqTextWindow(int w, int h, const char* title,
  98                        vector<Sequence> some_Seqs):Fl_Window(w,h,title)
  99 {
 100   string a_name;
 101   color(FL_WHITE);
 102   the_seqs = some_Seqs;
 103
 104
 105   seq_id = -1;
 106   seq_start = 1000000;
 107   seq_end = -1000000;
 108
 109   begin();
 110
 111   seq_id_input = new Fl_Input(80,10,30,30, "Seq num: ");
 112   seq_id_input->value("");
 113   seq_id_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_id_cb, this);
 114
 115   seq_start_input = new Fl_Input(160,10,100,30, " start: ");
 116   seq_start_input->value("");
 117   seq_start_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_start_cb, this);
 118
 119   seq_end_input = new Fl_Input(310,10,100,30, "end: ");
 120   seq_end_input->value("");
 121   seq_end_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_end_cb, this);
 122
 123   seq_display = new Fl_Multiline_Output(10, 50, w-20, h-60, "");
 124   seq_display->value("");
 125
 126   //seq_display2 = new Fl_Text_Display(10,100, w-20, h-110,"");
 127
 128   // button to get the sequence
 129   get_seq_but = new Fl_Button(w-80,10,80,30,"Get Seq");
 130   get_seq_but->callback((Fl_Callback*)get_seq_cb, this);
 131
 132
 133   end();
 134   //resizable(this);
 135   show();
 136 }
 137
 138
 139 SeqTextWindow::~SeqTextWindow(){}
 140
 141 /*
 142   cout << "fee\n";
 143   cout << "fie\n";
 144   cout << "foe\n";
 145   cout << "fum\n";
 146 */