gui/SeqWindow.cpp

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   3 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   4
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  11 #include "gui/SeqWindow.hpp"
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  13 #include <sstream>
  14
  15 #include <FL/Fl.H>
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  17 using namespace std;
  18
  19 void
  20 set_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  21 {
  22   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  23   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  24   T->real_set_align_cb(blah->which_align);
  25 }
  26
  27
  28 void
  29 SeqWindow::real_set_align_cb(int which_align)
  30 {
  31   seq_box->align_offsets(which_align);
  32   seq_box->redraw();
  33 }
  34
  35
  36 void
  37 show_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  38 {
  39   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  40   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  41   T->real_show_align_cb(blah->which_align);
  42 }
  43
  44
  45 void
  46 SeqWindow::real_show_align_cb(int which_align)
  47 {
  48   vector<int> a_path;
  49   int window_length;
  50
  51   cout << "fumish\n";
  52   seq_box->toggle_align(which_align);
  53   seq_box->redraw();
  54 }
  55
  56
  57 void
  58 toggle_bars_cb(Fl_Button* o, void* v)
  59 {
  60   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  61   T->real_toggle_bars_cb();
  62 }
  63
  64
  65 void
  66 SeqWindow::real_toggle_bars_cb()
  67 {
  68   seq_box->toggle_bars();
  69 }
  70
  71
  72 void
  73 toggle_motifs_cb(Fl_Button* o, void* v)
  74 {
  75   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  76   T->real_toggle_motifs_cb();
  77 }
  78
  79
  80 void
  81 SeqWindow::real_toggle_motifs_cb()
  82 {
  83   seq_box->toggle_motifs();
  84 }
  85
  86
  87 // main code, window creation
  88
  89 SeqWindow::SeqWindow(int w, int h, const char* title, int sq_num,
  90                      vector<Sequence> *some_seqs,
  91                      list<ConservedPath > some_paths,
  92                      vector<int> some_lens,
  93                      vector<fltk_motif> *some_motifs):
  94   Fl_Double_Window(w,h,title)
  95 {
  96   menu_align_data_bundle * some_menu_data;
  97   int window_length, align_number;
  98   int i;
  99   ostringstream align_id_ostr;
 100   string align_id_string;
 101   list<ConservedPath >::iterator align_iter;
 102
 103   // most of this stuff is here just to pass to SeqView object
 104   // some is needed to setup the window menus
 105   seq_num = sq_num;
 106   S = some_seqs;
 107   P = some_paths;
 108   seq_lens = some_lens;
 109   the_motifs = some_motifs;
 110
 111
 112   begin();
 113   color(FL_WHITE);
 114   resizable(this);
 115
 116   // make the menu that allows alignment selection
 117   choose_align_menu = new Fl_Menu_Button(5, 2, 180, 30, "Choose Alignment");
 118   choose_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 119   choose_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 120   choose_align_menu->clear();
 121
 122   // make the menu that allows alignment selection
 123   show_align_menu = new Fl_Menu_Button(190, 2, 180, 30, "Show Alignment");
 124   show_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 125   show_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 126   show_align_menu->clear();
 127
 128
 129   // adds menu items for each path
 130   align_iter = P.begin();
 131   align_number = 0;
 132   while(align_iter != P.end())
 133   {
 134     some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 135     some_menu_data->swm_ptr = this;
 136     some_menu_data->which_align = align_number;
 137     align_id_ostr << (*align_iter).window_size << ": ";
 138     for(i = 0; i != seq_num; i++)
 139       align_id_ostr << (*align_iter).track_indexes[i] << ", ";
 140     align_id_string = align_id_ostr.str();
 141     choose_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 142                            (Fl_Callback *) set_align_cb,
 143                            (void*) some_menu_data);
 144     show_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 145                          (Fl_Callback *) show_align_cb,
 146                          (void*) some_menu_data, FL_MENU_TOGGLE|FL_MENU_VALUE);
 147
 148     align_id_ostr.str("");
 149     ++align_number;
 150     ++align_iter;
 151   }
 152
 153   Fl_Button *test_but = new Fl_Button(375, 2, 150, 30, "Toggle Motifs");
 154   test_but->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 155   test_but->box(FL_BORDER_BOX);
 156   test_but->callback((Fl_Callback*) toggle_motifs_cb, this);
 157
 158   toggle_bars = new Fl_Button(530, 2, 150, 30, "Toggle 10bp bars");
 159   toggle_bars->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 160   toggle_bars->box(FL_BORDER_BOX);
 161   toggle_bars->callback((Fl_Callback*) toggle_bars_cb, this);
 162
 163
 164   // make the view of the sequence
 165   seq_box = new SeqView(0, 34, w, h-34);
 166   seq_box->setup(analysis_name, seq_num, S, P, seq_lens, the_motifs);
 167   //real_set_align_cb(2);
 168
 169   end();
 170   Fl::visual(FL_DOUBLE|FL_INDEX);
 171   show();
 172 }