gui/SeqWindow.hpp

   1 #ifndef _MUSSA_GUI_SEQ_H_
   2 #define _MUSSA_GUI_SEQ_H_
   3 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   4 //  http://mussa.caltech.edu/
   5 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   6
   7 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   8 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
   9 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
  10 // file for more information, or contact Tristan directly.
  11
  12 #include <iostream>
  13 #include <list>
  14 #include <string>
  15 #include <vector>
  16
  17 #include "gui/SeqView.hpp"
  18
  19 #include <FL/Fl_Menu_Bar.H>
  20 #include <FL/Fl_Menu_Item.H>
  21 #include <FL/Fl_Menu_Button.H>
  22 #include <FL/Fl_Double_Window.H>
  23
  24 class SeqWindow : public Fl_Double_Window
  25 {
  26   private:
  27     std::string analysis_name;
  28     int base_window_len;
  29
  30     //this data is passed as pointers to the instantiated classes
  31     std::vector<Sequence> *S;
  32     // list of paths in selection box
  33     std::list<ConservedPath > P;
  34     std::vector<int> seq_lens;
  35     //pointer to passed fltk_motif data
  36     std::vector<fltk_motif> *the_motifs;
  37
  38     int x_max, y_max;
  39     Fl_Menu_Button *choose_align_menu;
  40     Fl_Menu_Button *show_align_menu;
  41     Fl_Button *toggle_bars;
  42     SeqView *seq_box;
  43
  44   public:
  45     int seq_num;
  46
  47     SeqWindow(int w, int h, const char* title, int sq_num,
  48               std::vector<Sequence> *some_seqs,
  49               std::list<ConservedPath > some_paths,
  50               std::vector<int> some_lens,
  51               std::vector<fltk_motif> *some_motifs);
  52     virtual ~SeqWindow(){ std::cout << "dying\n"; }
  53
  54     void make_choose_menu();
  55     void make_show_menu();
  56     void real_set_align_cb(int which_align);
  57     void real_show_align_cb(int which_align);
  58     void real_toggle_bars_cb();
  59     void real_toggle_motifs_cb();
  60 };
  61
  62
  63 struct menu_align_data_bundle
  64 {
  65   SeqWindow * swm_ptr;
  66   int which_align;
  67 };
  68 #endif