mussa_gui_conn.cc

   1 #include "mussa_gui_conn.hh"
   2
   3
   4
   5 void
   6 ConnView::setup(string name, int sq_num, int win_len,
   7                 vector<Sequence> *some_seqs,
   8                 Nway_Paths *some_paths)
   9 {
  10   int i;
  11   Sequence a_seq;
  12
  13   ana_name = name;
  14   seq_num = sq_num;
  15   window = win_len;
  16   S = some_seqs;
  17   P = some_paths;
  18
  19   for(i = 0; i < seq_num; ++i)
  20   {
  21     a_seq = (*S)[i];
  22     seq_lens.push_back(a_seq.len());
  23   }
  24
  25   x_scale_factor = (float) seq_lens[0] / x_max;
  26   cout << "scale factor is " << x_scale_factor << endl;
  27   y_seq_incre = (y_max-20) / (seq_num - 1);
  28 }
  29
  30
  31 void
  32 ConnView::scale_paths()
  33 {
  34   vector<int> a_path;
  35   list<vector<int> >::iterator pathz_i;
  36   int i2;
  37
  38
  39   scaled_pathz.clear();
  40
  41   for(pathz_i = P->pathz.begin(); pathz_i != P->pathz.end(); ++pathz_i)
  42   {
  43     a_path = *pathz_i;
  44     for(i2 = 0; i2 < seq_num; i2++)
  45       a_path[i2] = (int) (a_path[i2] / x_scale_factor);
  46     scaled_pathz.push_back(a_path);
  47   }
  48 }
  49
  50
  51
  52
  53 void
  54 ConnView::draw()
  55 {
  56   list<vector<int> >::iterator i;
  57   int i2, y_loc, x_loc;
  58   vector<int> a_path;
  59
  60   fl_color(FL_RED);
  61   fl_line_style(FL_SOLID, 1, NULL);
  62
  63   for(i = scaled_pathz.begin(); i != scaled_pathz.end(); ++i)
  64   {
  65     a_path = *i;
  66     y_loc = 10;
  67     for(i2 = seq_num - 1; i2 > 0; i2--)
  68     {
  69       // RC case handling
  70       // ugh, and xor...only want blue if one of the nodes is rc
  71       if ( ((a_path[i2] < 0) || (a_path[i2-1] < 0)) &&
  72            !((a_path[i2] < 0) && (a_path[i2-1] < 0)) )
  73         fl_color(FL_BLUE);
  74
  75       fl_line((int)abs(a_path[i2]),y_loc,(int)abs(a_path[i2-1]),y_loc + y_seq_incre);
  76       y_loc += y_seq_incre;
  77       fl_color(FL_RED);
  78     }
  79   }
  80
  81   fl_color(FL_BLACK);
  82   fl_line_style(FL_SOLID, 3, NULL);
  83   y_loc = 10;
  84   for(i2 = seq_num - 1; i2 >= 0; i2--)
  85   {
  86     x_loc = (int)(seq_lens[i2] / x_scale_factor);
  87     fl_line(0,y_loc,x_loc,y_loc);
  88     y_loc += y_seq_incre;
  89   }
  90 }
  91
  92 void
  93 ConnView::spawnSeq()
  94 {
  95   int seq_box_x;
  96
  97   Fl_Window *seq_window = new Fl_Window(x_max, y_max, "Mussa Sequence");
  98   Fl_Scroll *scroll_seq = new Fl_Scroll(0, 0, x_max, y_max);
  99
 100   seq_box_x = 32000;
 101     //seq_lens[0]*14;
 102   SeqView *seq_box = new SeqView(0, 0, seq_box_x, y_max-20);
 103   seq_box->setup(ana_name, seq_num, window, S, P, seq_lens);
 104
 105   seq_window->end();
 106   seq_window->show();
 107 }