mussa_gui_conn_view.hh

   1 #include "mussa_gui_subana.hh"
   2
   3 #include <sstream>
   4
   5 class ConnView : public Fl_Box
   6 {
   7   public:
   8     ConnView(int x_top,int y_top,int x_bot,int y_bot) :
   9       Fl_Box(x_top,y_top,x_bot,y_bot)
  10     {}
  11
  12     void setup(string name, int sq_num, int win_len,
  13                vector<Sequence> *, Nway_Paths *);
  14     void scale_paths();
  15
  16     void spawnSeq();
  17     void find_motifs();
  18     void annot_win();
  19
  20     void toggle_bars();
  21     void set_bar_interval(int new_bar_len);
  22     void toggle_lines();
  23     void set_line_interval(int new_line_len);
  24
  25
  26   private:
  27     string ana_name;
  28     int seq_num, window, threshold;
  29     bool win_append, thres_append;
  30
  31   //this data is passed as pointers to the instantiated classes
  32     vector<Sequence> *S;
  33     Nway_Paths *P;
  34
  35     int name_pad, y_pad;
  36     float x_scale_factor;
  37     int y_seq_incre;
  38     int drag_start, drag_end;
  39     float y_drag_start;
  40     int ref_seq_num, max_seq_len;
  41     bool dragging, selected;
  42     list<bool> highlight;
  43
  44   //path data scaled for current view size
  45     list<vector<int> > scaled_pathz;
  46     vector<int> seq_lens;
  47     vector<int> seq_scales;
  48     int bar_interval, line_interval;
  49     bool show_bars, show_lines;
  50
  51   //keeps track of all the motifs the user has inputed
  52     vector<motif> some_motifs;
  53     MotifWindow *motif_find_window;
  54
  55   //keeps track of the colors assigned to each motif type
  56     vector<annot_color> some_annots;
  57     AnnotWindow *annot_color_window;
  58
  59     SeqWindow *a_seq_win;
  60
  61     void draw();
  62     void draw_paths();
  63     void draw_sequence_stuff();
  64
  65     void resize(int x, int y, int w, int h);
  66     int handle(int e);
  67     void check_new_motifs();
  68
  69   //for drawing function debugging
  70     void reporter(string var, int value);
  71     void report_float(string var, float value);
  72 };