mussa_gui_seq.cc

   1 #include "mussa_gui_seq.hh"
   2 #include <sstream>
   3
   4
   5 void
   6 set_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
   7 {
   8   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
   9   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  10   T->real_set_align_cb(blah->which_align);
  11 }
  12
  13
  14 void
  15 SeqWindow::real_set_align_cb(int which_align)
  16 {
  17   vector<int> a_path;
  18   int window_length;
  19
  20
  21   a_path = *P.begin();
  22   window_length = a_path[0];
  23   cout << window_length << endl;
  24
  25   cout << "fum1\n";
  26   seq_box->align_offsets(which_align);
  27   seq_box->redraw();
  28 }
  29
  30
  31 void
  32 show_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  33 {
  34   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  35   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  36   T->real_show_align_cb(blah->which_align);
  37 }
  38
  39
  40 void
  41 SeqWindow::real_show_align_cb(int which_align)
  42 {
  43   vector<int> a_path;
  44   int window_length;
  45
  46
  47   cout << "fumish\n";
  48   seq_box->toggle_align(which_align);
  49   seq_box->redraw();
  50 }
  51
  52
  53 void
  54 toggle_bars_cb(Fl_Button* o, void* v)
  55 {
  56   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  57   T->real_toggle_bars_cb();
  58 }
  59
  60
  61 void
  62 SeqWindow::real_toggle_bars_cb()
  63 {
  64   seq_box->toggle_bars();
  65 }
  66
  67
  68 void
  69 toggle_motifs_cb(Fl_Button* o, void* v)
  70 {
  71   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  72   T->real_toggle_motifs_cb();
  73 }
  74
  75
  76 void
  77 SeqWindow::real_toggle_motifs_cb()
  78 {
  79   seq_box->toggle_motifs();
  80 }
  81
  82
  83 // main code, window creation
  84
  85 SeqWindow::SeqWindow(int w, int h, const char* title, int sq_num,
  86                      vector<Sequence> *some_seqs,
  87                      list<vector<int> > some_paths,
  88                      vector<int> some_lens,
  89                      vector<motif> *some_motifs):
  90   Fl_Double_Window(w,h,title)
  91 {
  92   menu_align_data_bundle * some_menu_data;
  93   vector<int> a_path;
  94   int window_length, align_number;
  95   int i;
  96   ostringstream align_id_ostr;
  97   string align_id_string;
  98   list<vector<int> >::iterator align_iter;
  99
 100
 101
 102   // most of this stuff is here just to pass to SeqView object
 103   // some is needed to setup the window menus
 104   seq_num = sq_num;
 105   S = some_seqs;
 106   P = some_paths;
 107   seq_lens = some_lens;
 108   the_motifs = some_motifs;
 109
 110
 111   begin();
 112   color(FL_WHITE);
 113   resizable(this);
 114
 115   // make the menu that allows alignment selection
 116   choose_align_menu = new Fl_Menu_Button(5, 2, 180, 30, "Choose Alignment");
 117   choose_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 118   choose_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 119   choose_align_menu->clear();
 120
 121   // make the menu that allows alignment selection
 122   show_align_menu = new Fl_Menu_Button(190, 2, 180, 30, "Show Alignment");
 123   show_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 124   show_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 125   show_align_menu->clear();
 126
 127
 128   // adds menu items for each path
 129   align_iter = P.begin();
 130   align_number = 0;
 131   while(align_iter != P.end())
 132   {
 133     some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 134     some_menu_data->swm_ptr = this;
 135     some_menu_data->which_align = align_number;
 136     align_id_ostr << (*align_iter)[0] << ": ";
 137     for(i = 1; i <= seq_num; i++)
 138       align_id_ostr << (*align_iter)[i] << ", ";
 139     align_id_string = align_id_ostr.str();
 140     choose_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 141                            (Fl_Callback *) set_align_cb,
 142                            (void*) some_menu_data);
 143     show_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 144                          (Fl_Callback *) show_align_cb,
 145                          (void*) some_menu_data, FL_MENU_TOGGLE|FL_MENU_VALUE);
 146
 147     align_id_ostr.str("");
 148     ++align_number;
 149     ++align_iter;
 150   }
 151
 152   /*
 153   show_align_menu->add("f&ee");
 154   show_align_menu->add("f&ie");
 155   show_align_menu->add("f&oe");
 156   show_align_menu->add("f&um");
 157   */
 158
 159   Fl_Button *test_but = new Fl_Button(375, 2, 150, 30, "Toggle Motifs");
 160   test_but->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 161   test_but->box(FL_BORDER_BOX);
 162   test_but->callback((Fl_Callback*) toggle_motifs_cb, this);
 163
 164   toggle_bars = new Fl_Button(530, 2, 150, 30, "Toggle 10bp bars");
 165   toggle_bars->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 166   toggle_bars->box(FL_BORDER_BOX);
 167   toggle_bars->callback((Fl_Callback*) toggle_bars_cb, this);
 168
 169
 170   // make the view of the sequence
 171   seq_box = new SeqView(0, 34, w, h-34);
 172   seq_box->setup(ana_name, seq_num, S, P, seq_lens, the_motifs);
 173   //real_set_align_cb(2);
 174
 175   end();
 176   Fl::visual(FL_DOUBLE|FL_INDEX);
 177   show();
 178 }
 179
 180
 181
 182 /*
 183   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 184   some_menu_data->swm_ptr = this;
 185   some_menu_data->which_align = 2;
 186   choose_align_menu->add("f&ie", FL_ALT+'i', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 187                   (void*) some_menu_data);
 188
 189   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 190   some_menu_data->swm_ptr = this;
 191   some_menu_data->which_align = 3;
 192   choose_align_menu->add("f&oe", FL_ALT+'o', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 193                   (void*) some_menu_data);
 194
 195   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 196   some_menu_data->swm_ptr = this;
 197   some_menu_data->which_align = 4;
 198   choose_align_menu->add("f&um", FL_ALT+'u', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 199                   (void*) some_menu_data);
 200 */
 201
 202
 203
 204