mussa_gui_seq.hh

   1 #include "mussa_gui_seq_view.hh"
   2
   3 #include <FL/Fl_Menu_Bar.H>
   4 #include <FL/Fl_Menu_Item.H>
   5 #include <FL/Fl_Menu_Button.H>
   6 #include <FL/Fl_Double_Window.H>
   7
   8
   9 class SeqWindow : public Fl_Double_Window
  10 {
  11   private:
  12     string ana_name;
  13     int base_window_len;
  14
  15     //this data is passed as pointers to the instantiated classes
  16     vector<Sequence> *S;
  17     // list of paths in selection box
  18     list<vector<int> > P;
  19     vector<int> seq_lens;
  20     //pointer to passed motif data
  21     vector<motif> *the_motifs;
  22
  23     int x_max, y_max;
  24     Fl_Menu_Button *choose_align_menu;
  25     Fl_Menu_Button *show_align_menu;
  26     Fl_Button *toggle_bars;
  27     SeqView *seq_box;
  28
  29   public:
  30     int seq_num;
  31
  32     SeqWindow(int w, int h, const char* title, int sq_num,
  33               vector<Sequence> *some_seqs,
  34               list<vector<int> > some_paths, vector<int> some_lens,
  35               vector<motif> *some_motifs);
  36     virtual ~SeqWindow(){ cout << "dying\n"; }
  37
  38     void make_choose_menu();
  39     void make_show_menu();
  40     void real_set_align_cb(int which_align);
  41     void real_show_align_cb(int which_align);
  42     void real_toggle_bars_cb();
  43     void real_toggle_motifs_cb();
  44 };
  45
  46
  47
  48 struct menu_align_data_bundle
  49 {
  50   SeqWindow * swm_ptr;
  51   int which_align;
  52 };