mussa_gui_seq_text.cc

   1 #include "mussa_gui_seq_text.hh"
   2
   3
   4 void
   5 get_seq_cb(Fl_Button* o, void* v)
   6 {
   7   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
   8   T->real_get_seq_cb();
   9 }
  10
  11 void
  12 SeqTextWin::real_get_seq_cb()
  13 {
  14   string sub_seq_formatted;
  15   int seq_len, i, line_len;
  16
  17
  18   cout << "length = " << seq_end-seq_start << endl;
  19
  20   // make sure inputed values within valid ranges
  21   if ((seq_end > seq_start) && (seq_id > -1) && (seq_id < the_Seqs.size()) )
  22   {
  23     sub_sequence = the_Seqs[seq_id].subseq(seq_start, seq_end-seq_start);
  24
  25     sub_seq_formatted = "";
  26     seq_len = sub_sequence.size();
  27     line_len = 40;
  28     for (i = 0; i < seq_len; i += line_len)
  29     {
  30       sub_seq_formatted.append(sub_sequence.substr(i,line_len));
  31       sub_seq_formatted.append("\n");
  32     }
  33
  34     seq_display->value((const char *)sub_seq_formatted.c_str());
  35   }
  36 }
  37
  38
  39 // *** input seq index id
  40
  41 void
  42 set_seq_id_cb(Fl_Input* o, void* v)
  43 {
  44   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  45   T->real_set_seq_id_cb(o);
  46 }
  47
  48 void
  49 SeqTextWin::real_set_seq_id_cb(Fl_Input* o)
  50 {
  51   seq_id = atoi(o->value()) - 1;   // -1 since arrays start at 0
  52 }
  53
  54
  55 // *** input seq start index
  56
  57 void
  58 set_seq_start_cb(Fl_Input* o, void* v)
  59 {
  60   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  61   T->real_set_seq_start_cb(o);
  62 }
  63
  64 void
  65 SeqTextWin::real_set_seq_start_cb(Fl_Input* o)
  66 {
  67   seq_start = atoi(o->value());
  68 }
  69
  70 // *** input seq end index
  71
  72 void
  73 set_seq_end_cb(Fl_Input* o, void* v)
  74 {
  75   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  76   T->real_set_seq_end_cb(o);
  77 }
  78
  79 void
  80 SeqTextWin::real_set_seq_end_cb(Fl_Input* o)
  81 {
  82   seq_end = atoi(o->value());
  83 }
  84
  85
  86 SeqTextWin::SeqTextWin(int w, int h, const char* title,
  87                        vector<Sequence> some_Seqs):Fl_Window(w,h,title)
  88 {
  89   string a_name;
  90   color(FL_WHITE);
  91   the_Seqs = some_Seqs;
  92
  93
  94   seq_id = -1;
  95   seq_start = 1000000;
  96   seq_end = -1000000;
  97
  98   begin();
  99
 100   seq_id_input = new Fl_Input(80,10,30,30, "Seq num: ");
 101   seq_id_input->value("");
 102   seq_id_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_id_cb, this);
 103
 104   seq_start_input = new Fl_Input(160,10,100,30, " start: ");
 105   seq_start_input->value("");
 106   seq_start_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_start_cb, this);
 107
 108   seq_end_input = new Fl_Input(310,10,100,30, "end: ");
 109   seq_end_input->value("");
 110   seq_end_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_end_cb, this);
 111
 112   seq_display = new Fl_Multiline_Output(10, 50, w-20, h-60, "");
 113   seq_display->value("");
 114
 115   //seq_display2 = new Fl_Text_Display(10,100, w-20, h-110,"");
 116
 117   // button to get the sequence
 118   get_seq_but = new Fl_Button(w-80,10,80,30,"Get Seq");
 119   get_seq_but->callback((Fl_Callback*)get_seq_cb, this);
 120
 121
 122   end();
 123   //resizable(this);
 124   show();
 125 }
 126
 127
 128 SeqTextWin::~SeqTextWin(){}
 129
 130 /*
 131   cout << "fee\n";
 132   cout << "fie\n";
 133   cout << "foe\n";
 134   cout << "fum\n";
 135 */