qui/SubanalysisWindow.cpp

   1 #include "qui/SubanalysisWindow.hpp"
   2 #include "qui/MussaWindow.hpp"
   3
   4 #include "mussa_exceptions.hpp"
   5 #include "alg/mussa.hpp"
   6
   7 #include <QVBoxLayout>
   8 #include <QHBoxLayout>
   9 #include <QGridLayout>
  10
  11 SubanalysisWindow::SubanalysisWindow(QWidget *parent)
  12   : QWidget(parent),
  13     window(0),
  14     threshold(0),
  15     table(0),
  16     ok(0),
  17     cancel(0)
  18 {
  19   QGridLayout *parameterLayout = new QGridLayout;
  20
  21   QLabel *thresholdLabel = new QLabel(tr("threshold (bp)"));
  22   parameterLayout->addWidget(thresholdLabel, 0, 0);
  23   threshold = new QSpinBox(this);
  24   threshold->setValue(8);
  25   parameterLayout->addWidget(threshold, 1, 0);
  26   QLabel *windowLabel = new QLabel(tr("window (bp)"));
  27   parameterLayout->addWidget(windowLabel, 0, 1);
  28   window = new QSpinBox(this);
  29   window->setValue(10);
  30   parameterLayout->addWidget(window, 1, 1);
  31
  32   ok = new QPushButton(tr("&OK"), this);
  33   connect(ok, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(run()));
  34   cancel = new QPushButton(tr("Cancel"), this);
  35   connect(cancel, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(abort()));
  36   table = new QTableView(this);
  37   table->setModel(&model);
  38
  39   // layout buttons
  40   QHBoxLayout *buttonLayout = new QHBoxLayout;
  41   buttonLayout->addWidget(ok);
  42   buttonLayout->addWidget(cancel);
  43
  44   // layout verticle space
  45   QVBoxLayout *verticalLayout = new QVBoxLayout;
  46   verticalLayout->addLayout(parameterLayout);
  47   verticalLayout->addWidget(table);
  48   verticalLayout->addLayout(buttonLayout);
  49   setLayout(verticalLayout);
  50 }
  51
  52 SequenceLocationModel& SubanalysisWindow::getModel()
  53 {
  54   return model;
  55 }
  56
  57 void SubanalysisWindow::abort()
  58 {
  59   model.clear();
  60   hide();
  61 }
  62
  63 void SubanalysisWindow::run()
  64 {
  65   if (window == 0 or threshold == 0)
  66     throw std::runtime_error("SubanalysisWindow misconstructed");
  67
  68   std::auto_ptr<Mussa> m(new Mussa);
  69
  70   for(SequenceLocationModel::iterator itor = model.begin();
  71       itor != model.end();
  72       ++itor)
  73   {
  74     m->append_sequence(itor->getSelectedSequence());
  75   }
  76
  77   m->set_window(window->value());
  78   m->set_threshold(threshold->value());
  79   m->analyze();
  80   MussaWindow *mw = new MussaWindow(m.get());
  81   mw->show();
  82   model.clear();
  83   hide();
  84 }
  85