Update mussa to build on ubuntu 10.04 with qt 4.6.2 +boost 1.40.0.1
[mussa.git] / alg / flp.hpp
index 9b561874fbb1572c895fd15cc6542fc0dd52d963..2aed0ba4845dc5ba576b01b5746bde288bd67e11 100644 (file)
@@ -52,7 +52,7 @@ public:
     void seqcomp(const Sequence& seq1, const Sequence& seq2, bool is_RC);
     //bool FLPs::match_less(match *match1, match *match2);
     //void FLPs::sort();
-    //! Return all the matches for a particular window?
+    //! Return all the matches for a particular window? (index and score pairs)
     std::list<match> matches(int index) const;
     //! Return all the match indexes for a particular window?
     std::list<int> match_locations(int index) const;