Mouse scroll wheel zooming! =o)
[mussa.git] / qui / MussaWindow.cpp
index 2342ee783fbfc75bb06673923f5eed26ef3c69eb..b0342e40c0e186ba7731a28367735985f424d12d 100644 (file)
@@ -32,6 +32,14 @@ namespace fs = boost::filesystem;
 
 using namespace std;
 
+static void init_resources() {
+  static bool resources_loaded = false;
+  if (not resources_loaded) {
+    Q_INIT_RESOURCE(icons);
+    resources_loaded = true;
+  }
+}
+
 MussaWindow::MussaWindow(MussaRef analysis_, QWidget *parent) :
   QMainWindow(parent),
   analysis(analysis_),
@@ -60,13 +68,16 @@ MussaWindow::MussaWindow(MussaRef analysis_, QWidget *parent) :
   viewMussaAlignmentAction(0),
   manualAssistant(0)
 {
+  init_resources();
+  
+  default_dir.reset(new QDir(QDir::home().absolutePath()));
+  
   setupWidgets();
   setupActions();
   setupAssistant();
   setupMainMenu();
   
   setWindowIcon(QIcon(":/icons/mussa.png"));
-  default_dir.reset(new QDir(QDir::home().absolutePath()));
 
   setCentralWidget(browser);
   // well updatePosition isn't quite right as we really just need
@@ -78,6 +89,10 @@ MussaWindow::MussaWindow(MussaRef analysis_, QWidget *parent) :
   connect(zoom, SIGNAL(valueChanged(double)), 
           browser, SLOT(setZoom(double)));
   mussaViewTB->addWidget(zoom);
+  
+  // Mouse Wheel triggered zooming
+  connect(browser, SIGNAL(mouseWheelZoom(double)),
+          zoom, SLOT(setValue(double)));
 
   // threshold range is set in updateAnalysis  
   connect(threshold, SIGNAL(thresholdChanged(int)),
@@ -104,7 +119,18 @@ void MussaWindow::setAnalysis(MussaRef new_analysis)
   if (new_analysis != 0) {
     // only switch mussas if we loaded without error
     clear();
+    //std::cout << "analysis soft: " << analysis->get_soft_threshold()
+    //          << " new analysis soft: " << new_analysis->get_soft_threshold()
+    //          << "\n";
     analysis.swap(new_analysis);
+    //std::cout << "after swap soft thres: " << analysis->get_soft_threshold()
+    //          << "\n";
+    threshold->disconnect(this);
+    threshold->reset(analysis->get_threshold(),
+                     analysis->get_window(),
+                     analysis->get_soft_threshold());
+    connect(threshold, SIGNAL(thresholdChanged(int)),
+          this, SLOT(setSoftThreshold(int)));
     updateTitle();
     updateAnalysis();
   }
@@ -199,9 +225,11 @@ void MussaWindow::setupActions()
 
   //Save pixel map action
   saveBrowserPixmapAction = new QAction(tr("Save to image..."), this);
-  connect(saveBrowserPixmapAction, (SIGNAL(triggered())),
-         browser, SLOT(promptSaveBrowserPixmap()));
-  saveBrowserPixmapAction->setIcon(QIcon(":/icons/image2.png"));
+  if (browser) {
+    connect(saveBrowserPixmapAction, (SIGNAL(triggered())),
+            browser, SLOT(promptSaveBrowserPixmap()));
+    saveBrowserPixmapAction->setIcon(QIcon(":/icons/image2.png"));
+  }
 
   viewMussaAlignmentAction = new QAction(tr("View sequence alignment"), this);
   connect(viewMussaAlignmentAction, SIGNAL(triggered()),
@@ -248,10 +276,10 @@ void MussaWindow::setupMainMenu()
 
   newMenu = menuBar()->addMenu(tr("&Edit"));
   newMenu->addAction(editMotifsAction);
-  newMenu->addAction(browser->getCopySelectedSequenceAsStringAction());
-  newMenu->addAction(browser->getCopySelectedSequenceAsFastaAction());
+  if (browser) newMenu->addAction(browser->getCopySelectedSequenceAsStringAction());
+  if (browser) newMenu->addAction(browser->getCopySelectedSequenceAsFastaAction());
   newMenu->addAction(createSubAnalysisAction);
-  newMenu->addAction(browser->getEditSequencePropertiesAction());
+  if (browser) newMenu->addAction(browser->getEditSequencePropertiesAction());
  
   newMenu = menuBar()->addMenu(tr("&View"));
   newMenu->addAction(viewMussaAlignmentAction);
@@ -264,10 +292,12 @@ void MussaWindow::setupMainMenu()
   newMenu->addAction(aboutAction);
 
   // add some extra features to the context menu
-  QMenu *popupMenu = browser->getPopupMenu();
-  if (popupMenu) {
-    popupMenu->addAction(viewMussaAlignmentAction);
-    popupMenu->addAction(createSubAnalysisAction);
+  if (browser) {
+    QMenu *popupMenu = browser->getPopupMenu();
+    if (popupMenu) {
+      popupMenu->addAction(viewMussaAlignmentAction);
+      popupMenu->addAction(createSubAnalysisAction);
+    }
   }
 }
 
@@ -303,6 +333,9 @@ void MussaWindow::about()
   msg += "Version: ";
   msg += mussa_version;
   msg += "\n";
+  msg += "Qt: ";
+  msg += qVersion();
+  msg += "\n";
   msg += "OpenGL: ";
   msg += (char *)glGetString(GL_VERSION);
   msg += "\n";
@@ -311,6 +344,11 @@ void MussaWindow::about()
 
 void MussaWindow::clear()
 {
+  if (motif_editor != 0) {
+    motif_editor->hide();
+    delete motif_editor;
+  }
+  
   aligned_windows.clear();
   browser->clear();
 }
@@ -446,13 +484,11 @@ bool MussaWindow::isClearingAnalysisSafe()
 
 void MussaWindow::editMotifs()
 {
-  if (motif_editor != 0) {
-    motif_editor->hide();
-    delete motif_editor;
+  if (not motif_editor) {
+    motif_editor = new MotifEditor(analysis);
+    connect(motif_editor, SIGNAL(changedMotifs()), 
+            this, SLOT(updateAnnotations()));
   }
-  motif_editor = new MotifEditor(analysis);
-  connect(motif_editor, SIGNAL(changedMotifs()), 
-          this, SLOT(updateAnnotations()));
   motif_editor->show();
 }
 
@@ -610,14 +646,21 @@ void MussaWindow::newMussaWindow()
 
 void MussaWindow::setSoftThreshold(int value)
 {
+  //std::cout << "Soft: " << analysis->get_soft_threshold()
+  //          << " Value: " << value << "\n";
   if (analysis->get_soft_threshold() != value) {
     threshold->setEnabled( false );
+    //std::cout << "Updating!!!!\n";
     analysis->set_soft_threshold(value);
     analysis->nway();
     updateLinks();
     update();
     threshold->setEnabled( true );
   }
+  //else
+  //{
+  //  std::cout << "NOT Updating!!!!\n";
+  //}
 }
 
 void MussaWindow::showMussaToolbar()
@@ -712,6 +755,7 @@ void MussaWindow::updateAnalysis()
   // but it's possible for us to not have had a chance to set out sequences
   // yet.
   threshold->setRange(analysis->get_threshold(),analysis->get_window());
+  threshold->setBasepairThreshold(analysis->get_soft_threshold());
   updateLinks();
   browser->zoomOut();
   zoom->setValue(browser->zoom());