store motifs as sequences instead of strings
[mussa.git] / alg /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 1161 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 2337 annotation_colors.cpp
-rw-r--r-- 1796 annotation_colors.hpp
-rw-r--r-- 1824 color.cpp
-rw-r--r-- 836 color.hpp
-rw-r--r-- 3963 conserved_path.cpp
-rw-r--r-- 1892 conserved_path.hpp
-rw-r--r-- 7296 flp.cpp
-rw-r--r-- 3596 flp.hpp
-rw-r--r-- 5763 flp_seqcomp.cpp
-rw-r--r-- 17886 glseqbrowser.cpp
-rw-r--r-- 7040 glseqbrowser.hpp
-rw-r--r-- 8412 glsequence.cpp
-rw-r--r-- 4090 glsequence.hpp
-rw-r--r-- 737 module.mk
-rw-r--r-- 22129 mussa.cpp
-rw-r--r-- 8041 mussa.hpp
-rw-r--r-- 175 mussa_callback.hpp
-rw-r--r-- 7317 nway_entropy.cpp
-rw-r--r-- 9573 nway_other.cpp
-rw-r--r-- 13470 nway_paths.cpp
-rw-r--r-- 3642 nway_paths.hpp
-rw-r--r-- 4034 nway_refine.cpp
-rw-r--r-- 1682 parse_options.cpp
-rw-r--r-- 505 parse_options.hpp
-rw-r--r-- 27196 sequence.cpp
-rw-r--r-- 4918 sequence.hpp
-rw-r--r-- 1131 sequence_location.cpp
-rw-r--r-- 739 sequence_location.hpp
drwxr-xr-x - test