Merge commit 'upstream/0.5'

[pysam.git] / pysam.egg-info / SOURCES.txt

diff --git a/pysam.egg-info/SOURCES.txt b/pysam.egg-info/SOURCES.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6f8ca43
--- /dev/null
+++ b/pysam.egg-info/SOURCES.txt
@@ -0,0 +1,146 @@
+COPYING
+INSTALL
+KNOWN_BUGS
+MANIFEST.in
+THANKS
+ez_setup.py
+setup.cfg
+setup.py
+pysam/Pileup.py
+pysam/TabProxies.c
+pysam/TabProxies.pxd
+pysam/TabProxies.pyx
+pysam/VCF.py
+pysam/__init__.py
+pysam/csamtools.c
+pysam/csamtools.pxd
+pysam/csamtools.pyx
+pysam/ctabix.c
+pysam/ctabix.pxd
+pysam/ctabix.pyx
+pysam/cvcf.c
+pysam/cvcf.pxd
+pysam/cvcf.pyx
+pysam/namedtuple.py
+pysam/pysam_util.c
+pysam/pysam_util.h
+pysam/tabix_util.c
+pysam/version.py
+pysam.egg-info/PKG-INFO
+pysam.egg-info/SOURCES.txt
+pysam.egg-info/dependency_links.txt
+pysam.egg-info/not-zip-safe
+pysam.egg-info/requires.txt
+pysam.egg-info/top_level.txt
+samtools/bam.c.pysam.c
+samtools/bam.h
+samtools/bam2bcf.c.pysam.c
+samtools/bam2bcf.h
+samtools/bam2bcf_indel.c.pysam.c
+samtools/bam2depth.c.pysam.c
+samtools/bam_aux.c.pysam.c
+samtools/bam_cat.c.pysam.c
+samtools/bam_color.c.pysam.c
+samtools/bam_endian.h
+samtools/bam_import.c.pysam.c
+samtools/bam_index.c.pysam.c
+samtools/bam_lpileup.c.pysam.c
+samtools/bam_maqcns.c.pysam.c
+samtools/bam_maqcns.h
+samtools/bam_mate.c.pysam.c
+samtools/bam_md.c.pysam.c
+samtools/bam_pileup.c.pysam.c
+samtools/bam_plcmd.c.pysam.c
+samtools/bam_rmdup.c.pysam.c
+samtools/bam_rmdupse.c.pysam.c
+samtools/bam_sort.c.pysam.c
+samtools/bam_stat.c.pysam.c
+samtools/bam_tview.c.pysam.c
+samtools/bedidx.c.pysam.c
+samtools/bgzf.c.pysam.c
+samtools/bgzf.h
+samtools/cut_target.c.pysam.c
+samtools/errmod.c.pysam.c
+samtools/errmod.h
+samtools/faidx.c.pysam.c
+samtools/faidx.h
+samtools/glf.c.pysam.c
+samtools/glf.h
+samtools/kaln.c.pysam.c
+samtools/kaln.h
+samtools/khash.h
+samtools/klist.h
+samtools/knetfile.c.pysam.c
+samtools/knetfile.h
+samtools/kprobaln.c.pysam.c
+samtools/kprobaln.h
+samtools/kseq.h
+samtools/ksort.h
+samtools/kstring.c.pysam.c
+samtools/kstring.h
+samtools/msvc_compat.h
+samtools/phase.c.pysam.c
+samtools/pysam.h
+samtools/razf.c.pysam.c
+samtools/razf.h
+samtools/sam.c.pysam.c
+samtools/sam.h
+samtools/sam_header.c.pysam.c
+samtools/sam_header.h
+samtools/sam_view.c.pysam.c
+samtools/sample.c.pysam.c
+samtools/sample.h
+samtools/bcftools/bcf.c.pysam.c
+samtools/bcftools/bcf.h
+samtools/bcftools/bcf2qcall.c.pysam.c
+samtools/bcftools/bcfutils.c.pysam.c
+samtools/bcftools/call1.c.pysam.c
+samtools/bcftools/em.c.pysam.c
+samtools/bcftools/fet.c.pysam.c
+samtools/bcftools/index.c.pysam.c
+samtools/bcftools/kfunc.c.pysam.c
+samtools/bcftools/kmin.c.pysam.c
+samtools/bcftools/kmin.h
+samtools/bcftools/prob1.c.pysam.c
+samtools/bcftools/prob1.h
+samtools/bcftools/vcf.c.pysam.c
+samtools/misc/md5.c.pysam.c
+samtools/misc/md5.h
+samtools/win32/xcurses.h
+samtools/win32/zconf.h
+samtools/win32/zlib.h
+tabix/bam_endian.h
+tabix/bedidx.c.pysam.c
+tabix/bgzf.c.pysam.c
+tabix/bgzf.h
+tabix/bgzip.c.pysam.c
+tabix/index.c.pysam.c
+tabix/khash.h
+tabix/knetfile.c.pysam.c
+tabix/knetfile.h
+tabix/kseq.h
+tabix/ksort.h
+tabix/kstring.c.pysam.c
+tabix/kstring.h
+tabix/msvc_compat.h
+tabix/pysam.h
+tabix/tabix.h
+tests/00README.txt
+tests/Makefile
+tests/ex1.fa
+tests/ex1.sam.gz
+tests/ex10.sam
+tests/ex3.sam
+tests/ex4.sam
+tests/ex5.sam
+tests/ex6.sam
+tests/ex7.sam
+tests/ex8.sam
+tests/ex9_fail.bam
+tests/ex9_nofail.bam
+tests/example.gtf.gz
+tests/example.gtf.gz.tbi
+tests/example.py
+tests/pysam_test.py
+tests/segfault_tests.py
+tests/tabix_test.py
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