woldlab.caltech.edu Git - pysam.git/tree

drwxr-xr-x		..
-rw-r--r--	11908	bam.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	24720	bam.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10531	bam2bcf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1561	bam2bcf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	17210	bam2bcf_indel.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4572	bam2depth.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5023	bam_aux.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5826	bam_cat.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2823	bam_color.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1064	bam_endian.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	16402	bam_import.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	21396	bam_index.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5006	bam_lpileup.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2562	bam_mate.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	12906	bam_md.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	12984	bam_pileup.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	19672	bam_plcmd.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1524	bam_reheader.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5669	bam_rmdup.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4149	bam_rmdupse.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	13772	bam_sort.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3226	bam_stat.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	13623	bam_tview.c.pysam.c	blob \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	bcftools	tree \| history
-rw-r--r--	3902	bedidx.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	19964	bgzf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4617	bgzf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5691	cut_target.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3505	errmod.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	442	errmod.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10812	faidx.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3188	faidx.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	15250	kaln.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2072	kaln.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	17815	khash.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3472	klist.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	18376	knetfile.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1611	knetfile.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10542	kprobaln.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1568	kprobaln.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	8266	kseq.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10034	ksort.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5396	kstring.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2661	kstring.h	blob \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	misc	tree \| history
-rw-r--r--	20863	phase.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	82	pysam.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	24377	razf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4137	razf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5915	sam.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2625	sam.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	19284	sam_header.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	643	sam_header.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	13674	sam_view.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3004	sample.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	396	sample.h	blob \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	win32	tree \| history