htswanalysis/src/GetReadsInSnps/chrom_list.h

   1 #include <ext/hash_map>
   2
   3 #ifndef CHROMLIST_H
   4 #define CHROMLIST_H
   5
   6 using namespace std;
   7 using namespace __gnu_cxx;
   8
   9 struct eq_str {
  10   bool operator() (const string& a, const string& b) const {
  11     return(strcmp(a.c_str(), b.c_str()) == 0);
  12   }
  13 };
  14
  15 struct hash_str {
  16   size_t operator() (const string& a) const {
  17     hash<const char*> h;
  18     return(h(a.c_str()));
  19   }
  20 };
  21
  22 class ChromList : public hash_map<string, string, hash_str, eq_str> {
  23   public:
  24     ChromList(char* filename);
  25 };
  26
  27 #endif