Import of sampletracker.bzr revno 42! What a great revision number to migrate to...
[htsworkflow.git] / samplebc / samples / views.py
1 from django.http import HttpResponse, HttpResponseRedirect
2 from samplebc.samples import models
3 from django.core.exceptions import ObjectDoesNotExist
4 from django.template import Context, Template, RequestContext
5 from django.template.loader import get_template
6 from django.shortcuts import render_to_response
7
8 from django.utils.safestring import mark_safe
9
10 from samplebc.samples.forms import FreezerForm, ContainerForm, SampleForm
11 from samplebc.samples.models import Freezer, Container, Sample
12 from samplebc.samples.util import get_uuid, get_sampleid, assign_to_container
13 from samplebc.samples.errors import NoSpaceAvaliable
14 from samplebc import settings
15
16 # Barcode Magic!
17 from samplebc.bcmagic.forms import BarcodeMagicForm
18
19
20 import random
21 import ftplib
22 import StringIO
23
24
25 ################################################
26 # Util functions
27 ################################################
28
29
30 def print_zpl(zpl_text):
31     """
32     Sends zpl_text to printer
33     """
34     ftp = ftplib.FTP(host='131.215.54.194', user='blank', passwd='')
35     ftp.login()
36     ftp.storlines("STOR printme.txt", StringIO.StringIO(zpl_text))
37
38
39 def __center_line(line, width):
40     spaces_to_add = width - len(line)
41     
42     front_half = spaces_to_add / 2
43     back_half = spaces_to_add - front_half
44     
45     return (' ' * front_half) + line + (' ' * back_half)    
46
47
48   
49   
50 ################################################
51 # Container
52 ################################################
53
54 def container_index(request):
55     """
56     Returns an index of available to containers
57     """
58     container_list = Container.objects.all()
59     c = Context({'title': 'Container Index',
60                  'container_list': container_list})
61     t = get_template('container_index.html')
62     
63     return render_to_response('app.html', {
64         'app_name': "HTSW-SampleTracker",
65         'page_name': 'Container Index',
66         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
67         'select': 'container',
68         'body': t.render(c)
69     })
70     
71
72
73     
74 def container_summary(request, container_id):
75     """
76     Returns details of a container
77     """
78     # Retrieve container by UUID
79     try:
80         container = models.Container.objects.get(uuid=container_id)
81     except ObjectDoesNotExist, e:
82         msg = "Container (%s) does not exist." % (container_id)
83         return render_to_response('app.html', {
84             'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
85             'page_name': 'Container Summary',
86             'media': '',
87             'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
88             'select': 'container',
89             'body': msg
90         })
91     
92     # Retrieve samples from container
93     sample_list = container.sample_set.all()
94     
95     # Prepare a Sample Index of Contained Samples
96     cs = Context({'title': 'Contained Samples',
97                  'sample_list': sample_list})
98     ts = get_template('sample_index.html')
99     
100     # Render prepared samples into container summary
101     cc = Context({'container': container,
102                  'rendered_samples': ts.render(cs) })
103     tc = get_template('container_summary.html')
104     
105     # Render container summary to app html
106     return render_to_response('app.html', {
107         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
108         'page_name': 'Container Summary',
109         'media': '',
110         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
111         'select': 'container',
112         'body': tc.render(cc)
113     })
114
115
116 def container_add(request):
117     """
118     Form for adding a container.
119     """
120     # If user submitted the Container form.
121     if request.method == 'POST':
122         # Fill in ContainerForm with POSTed data.
123         form = ContainerForm(request.POST)
124         
125         # If the form is valid, process it.
126         if form.is_valid():
127             # Create new Container object from form data
128             c_obj = form.save(commit=False)
129             # Added UUID
130             c_obj.uuid = get_uuid()
131             # Save to DB.
132             c_obj.save()
133             # Save the many to many link data.
134             form.save_m2m()
135             return container_summary(request, c_obj.uuid)
136     else:
137         # If users first visit, create empty form.
138         form = ContainerForm()
139         
140     # Load form template
141     c = Context({'form': form,
142                  'action_url': '/samples/container/add/'})
143     t = get_template('generic_form.html')
144
145     return render_to_response('app.html', {
146         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
147         'page_name': 'Container Add',
148         'media': form.media,
149         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
150         'select': 'container',
151         'body': t.render(c)
152     })
153     
154 def container_edit(request, container_id):
155     """
156     Allow editing of a container
157     """
158     try:
159         container = models.Container.objects.get(uuid=container_id)
160     except ObjectDoesNotExist, e:
161         msg = "Container (%s) cannot be edited as it does not exist." % (container_id)
162         return render_to_response('app.html', {
163             'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
164             'page_name': 'Container Edit',
165             'media': '',
166             'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
167             'select': 'container',
168             'body': msg
169         })
170     
171     # If user submitted the container form.
172     if request.method == 'POST':
173         # Fill in ContainerForm with POSTed data.
174         form = ContainerForm(request.POST, instance=container)
175         
176         # If the form is valid, process it.
177         if form.is_valid():
178             # Save Container object from form data
179             c_obj = form.save(commit=True)
180             # Save many2many changes as well
181             #form.save_m2m() #Not needed when form.save(commit=True)
182             
183             return container_summary(request, c_obj.uuid)
184     else:
185         # If users first visit, create form from Container instance.
186         form = ContainerForm(instance=container)
187
188     # Load form template
189     c = Context({'form': form,
190                  'action_url': '%sedit/' % (container.get_absolute_url())})
191     t = get_template('generic_form.html')
192
193     return render_to_response('app.html', {
194         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
195         'page_name': 'Container Edit',
196         'media': form.media,
197         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
198         'select': 'container',
199         'body': t.render(c)
200     })
201
202
203
204 ################################################
205 # Freezer
206 ################################################
207
208 def freezer_index(request):
209     """
210     Returns an index of available freezers
211     """
212     freezer_list = Freezer.objects.all()
213     c = Context({'freezer_list': freezer_list})
214     t = get_template('freezer_index.html')
215     
216     return render_to_response('app.html', {
217         'app_name': "HTSW-SampleTracker",
218         'page_name': 'Freezer Index',
219         'media': '',
220         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
221         'select': 'freezer',
222         'body': t.render(c)
223     })
224     
225     
226 def freezer_summary(request, freezer_id):
227     """
228     Returns summary of freezer_id
229     """
230     # Retrieve freezer by UUID
231     try:
232         freezer = models.Freezer.objects.get(uuid=freezer_id)
233     except ObjectDoesNotExist, e:
234         msg = "Freezer (%s) does not exist." % (freezer_id)
235         return render_to_response('app.html', {
236                 'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
237                 'page_name': 'Freezer Summary',
238                 'media': '',
239                 'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
240                 'select': 'freezer',
241                 'body': msg
242                 })
243     
244     # List of contained containers
245     container_list = freezer.container_set.all()
246     
247     
248     # Render prepared container index into freezer summary
249     cf = Context({'freezer': freezer })
250     tf = get_template('freezer_summary.html')
251     
252     # Render Freezer summary to app html
253     return render_to_response('app.html', {
254         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
255         'page_name': 'Freezer Summary',
256         'media': '',
257         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
258         'select': 'freezer',
259         'body': tf.render(cf)
260     })
261
262
263 def freezer_add(request):
264     """
265     Allows you to add a new freezer.
266     """
267     # If user submitted the freezer form.
268     if request.method == 'POST':
269         # Fill in FreezerForm with POSTed data.
270         form = FreezerForm(request.POST)
271         
272         # If the form is valid, process it.
273         if form.is_valid():
274             # Create new Freezer object from form data
275             f_obj = form.save(commit=False)
276             # Added UUID
277             f_obj.uuid = get_uuid()
278             # Save to DB.
279             f_obj.save()
280             return freezer_summary(request, f_obj.uuid)
281     else:
282         # If users first visit, create empty form.
283         form = FreezerForm()
284
285     # Load form template
286     c = Context({'form': form,
287                  'action_url': '/samples/freezer/add/'})
288     t = get_template('generic_form.html')
289
290     return render_to_response('app.html', {
291         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
292         'page_name': 'Freezer Add',
293         'media': form.media,
294         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
295         'select': 'freezer',
296         'body': t.render(c)
297     })
298
299
300 def freezer_edit(request, freezer_id):
301     """
302     Allow editing of a freezer
303     """
304     try:
305         freezer = models.Freezer.objects.get(uuid=freezer_id)
306     except ObjectDoesNotExist, e:
307         msg = "Freezer (%s) cannot be edited as it does not exist." % (freezer_id)
308         return render_to_response('app.html', {
309                 'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
310                 'page_name': 'Freezer Summary',
311                 'media': '',
312                 'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
313                 'select': 'freezer',
314                 'body': msg
315                 })
316     
317     # If user submitted the freezer form.
318     if request.method == 'POST':
319         # Fill in FreezerForm with POSTed data.
320         form = FreezerForm(request.POST, instance=freezer)
321         
322         # If the form is valid, process it.
323         if form.is_valid():
324             # Save Freezer object from form data
325             f_obj = form.save(commit=True)
326             
327             return freezer_summary(request, f_obj.uuid)
328     else:
329         # If users first visit, create form from freezer instance.
330         form = FreezerForm(instance=freezer)
331
332     # Load form template
333     c = Context({'form': form,
334                  'action_url': '%sedit/' % (freezer.get_absolute_url())})
335     t = get_template('generic_form.html')
336
337     return render_to_response('app.html', {
338         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
339         'page_name': 'Freezer Edit',
340         'media': form.media,
341         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
342         'select': 'freezer',
343         'body': t.render(c)
344     })
345
346
347
348 ################################################
349 # Samples
350 ################################################
351
352 def sample_index(request):
353     """
354     return a list of samples and what we can do with them.
355     """
356     sample_list = models.Sample.objects.all()
357     
358     # Load form template
359     c = Context({'title': 'Sample Index',
360                  'sample_list': sample_list})
361     t = get_template('sample_index.html')
362     #html.append('%s <a href="/samples/sample/%s/print">(print)</a>' \
363     #            % (sample, sample.sampleid))
364         
365     return render_to_response('app.html', {
366         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
367         'page_name': 'Samples Index',
368         'media': '',
369         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
370         'select': 'samples',
371         'body': t.render(c)
372     })
373
374
375 def sample_homeless(request):
376     """
377     Returns an index of homeless samples
378     """
379     sample_list = Sample.objects.filter(container=None)
380     c = Context({'title': 'Homeless Samples',
381                  'sample_list': sample_list})
382     t = get_template('sample_homeless.html')
383     
384     return render_to_response('app.html', {
385         'app_name': "HTSW-SampleTracker",
386         'page_name': 'Homeless Samples',
387         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
388         'select': 'samples',
389         'body': t.render(c)
390     })
391     
392     
393 def sample_add(request):
394     """
395     Allow adding of a new sample
396     """
397     ASSIGNED_CONTAINER = False
398     
399     # If user submitted the sample form.
400     if request.method == 'POST':
401         # Fill in SampleForm with POSTed data.
402         form = SampleForm(request.POST)
403         
404         # If the form is valid, process it.
405         if form.is_valid():
406             # Create new Sample object from form data
407             s_obj = form.save(commit=False)
408             
409             # Add sample ID
410             s_obj.sampleid = get_sampleid()
411             
412             # If the user wants us to assign a container.
413             if form.cleaned_data['assign_container']:
414                 # Choose container
415                 try:
416                     assign_to_container(s_obj)
417                     ASSIGNED_CONTAINER = True
418                 except NoSpaceAvaliable, e:
419                     #return HttpResponse("<b>Error:</b> %s<br /><i>You will need to prepare a new container before continuing.</i>" \
420                     #                    % (e))
421                     ASSIGNED_CONTAINER = False
422                                     
423             # Save to DB.
424             s_obj.save()
425             
426             if not ASSIGNED_CONTAINER:
427                 msg = "NOTE: Sample is homeless"
428                 return sample_summary(request, s_obj.sampleid, msg=msg)
429
430             
431             msg = "Sample created."
432             return sample_summary(request, s_obj.sampleid, msg=msg)
433     else:
434         # If users first visit, create empty form.
435         form = SampleForm()
436
437     # Load form template
438     c = Context({'form': form,
439                  'action_url': '/samples/sample/add/'})
440     t = get_template('generic_form.html')
441
442     return render_to_response('app.html', {
443         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
444         'page_name': 'Sample Add',
445         'media': form.media,
446         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
447         'select': 'samples',
448         'body': t.render(c)
449     })
450     
451
452 def sample_edit(request, sampleid):
453     """
454     Allow editing of a sample
455     """
456     try:
457         sample = models.Sample.objects.get(sampleid=sampleid)
458     except ObjectDoesNotExist, e:
459         msg = "Sample (%s) cannot be edited as it does not exist." % (sampleid)
460         return render_to_response('app.html', {
461                     'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
462                     'page_name': 'Sample Edit',
463                     'media': '',
464                     'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
465                     'select': 'samples',
466                     'body': msg
467                 })
468     
469     # If user submitted the sample form.
470     if request.method == 'POST':
471         # Fill in SampleForm with POSTed data.
472         form = SampleForm(request.POST, instance=sample)
473         
474         # If the form is valid, process it.
475         if form.is_valid():
476             # Save Sample object from form data
477             s_obj = form.save(commit=True)
478             
479             msg = "Sample Update Saved"
480             return sample_summary(request, s_obj.sampleid, msg)
481     else:
482         # If users first visit, create form from sample instance.
483         form = SampleForm(instance=sample)
484
485     # Load form template
486     c = Context({'form': form,
487                  'action_url': '%sedit/' % (sample.get_absolute_url())})
488     t = get_template('generic_form.html')
489
490     return render_to_response('app.html', {
491         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
492         'page_name': 'Sample Edit',
493         'media': form.media,
494         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
495         'select': 'samples',
496         'body': t.render(c)
497     })
498
499
500 def sample_assign_container(request, sampleid):
501     """
502     Assigns sample to container using the assign to container algorithm
503     """
504     
505     sample = Sample.objects.get(sampleid=sampleid)
506     
507     try:
508         assign_to_container(sample)
509     except NoSpaceAvaliable, e:
510         return render_to_response('app.html', {
511         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
512         'page_name': 'Sample Assign',
513         'media': '',
514         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
515         'select': 'samples',
516         'body': mark_safe("<b>Error:</b> %s<br /><i>You will need to prepare a new container before continuing.</i>" \
517                             % (e))
518         })
519         
520     sample.save()
521     
522     body = 'Sample (<a href="%s">%s</a>) assigned to container (<a href="%s">%s</a>)' \
523            % (sample.get_absolute_url(), str(sample), sample.container.get_absolute_url(), str(sample.container))
524     
525     return render_to_response('app.html', {
526             'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
527             'page_name': 'Sample Assign',
528             'media': '',
529             'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
530             'select': 'samples',
531             'body': mark_safe(body),
532             })
533
534
535 def sample_summary(request, sampleid, msg=None):
536     """
537     Display a summary of a given sample
538     """
539     try:
540         sample = models.Sample.objects.get(sampleid=sampleid)
541     except ObjectDoesNotExist, e:
542         msg = "Sample (%s) does not exist." % (sampleid)
543         return render_to_response('app.html', {
544                     'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
545                     'page_name': 'Sample Summary',
546                     'media': '',
547                     'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
548                     'select': 'samples',
549                     'body': msg
550                 })
551     
552     c = Context({'sample': sample,
553                  'msg': msg,})
554     t = get_template('sample_summary.html')
555     
556     return render_to_response('app.html', {
557         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
558         'page_name': 'Sample Summary',
559         'media': '',
560         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
561         'select': 'samples',
562         'body': t.render(c)
563     })
564
565     
566 def sample_print(request, sampleid):
567     """
568     prints a sample!
569     """
570     
571     try:
572         sample = models.Sample.objects.get(sampleid=sampleid)
573     except ObjectDoesNotExist:
574         return HttpResponse('Sample (%s) does not exist!' % (sampleid))
575     
576     params = {}
577     params['fullid'] = str(sample)
578     params['sampleid'] = __center_line("s|%s" % (sample.sampleid), 16)
579     params['line1'] = __center_line(sample.name[0:10], 10)
580     params['line2'] = __center_line(sample.name[10:25], 14)
581     params['line3'] = __center_line('ExpType %s' % (sample.sample_type.name[0:8]), 15)
582     params['slot_num'] = random.randint(1,81)
583     
584     c = Context(params)
585     t = get_template('half_inch_samples.txt')
586     print_zpl(t.render(c))
587     
588     return HttpResponse('print command for sample %s sent.' % (sample.sampleid))
589
590
591 ################################################
592 # Barcode Magic Commands
593 ################################################
594
595 def cmd_move_sample(request):
596     """
597     Moves a sample to a target container
598     """
599     return render_to_response('app.html', {
600         'app_name': settings.HTSW_ST_APPNAME,
601         'page_name': 'CMD: Move Sample',
602         'media': '',
603         'bcmagic': BarcodeMagicForm(),
604         'select': 'samples',
605         'body': ""
606     })