alg/test/test_sequence_location.cpp

   1 #define BOOST_TEST_DYN_LINK
   2 #define BOOST_TEST_MODULE
   3 #include <boost/test/unit_test.hpp>
   4
   5 #include "alg/sequence_location.hpp"
   6 #include "alg/sequence.hpp"
   7
   8 BOOST_AUTO_TEST_CASE( basic_sequence_location )
   9 {
  10   Sequence s("AAGGCCTT");
  11
  12   SequenceLocation sl(s, 0, 2);
  13
  14   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getLeft(), 0 );
  15   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getRight(), 2 );
  16   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getCount(), 2 );
  17
  18   sl.setLeft(1);
  19   sl.setRight(3);
  20
  21   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getLeft(), 1 );
  22   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getRight(), 3 );
  23   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getCount(), 2 );
  24 }
  25
  26 BOOST_AUTO_TEST_CASE( memory_test )
  27 {
  28   SequenceLocation *sl;
  29   // storing references is a bad idea
  30   {
  31     Sequence s("AAGGCCTT");
  32     sl = new SequenceLocation(s, 0, 2);
  33   }
  34
  35   BOOST_CHECK_EQUAL(sl->getSequence(), "AAGGCCTT");
  36   BOOST_CHECK_EQUAL(sl->getSelectedSequence(), "AA");
  37 }