alg/test/test_sequence_location.cpp

   1 #include <boost/test/auto_unit_test.hpp>
   2
   3 #include "alg/sequence_location.hpp"
   4 #include "alg/sequence.hpp"
   5
   6 BOOST_AUTO_TEST_CASE( basic_sequence_location )
   7 {
   8   Sequence s("AAGGCCTT");
   9
  10   SequenceLocation sl(s, 0, 2);
  11
  12   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getLeft(), 0 );
  13   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getRight(), 2 );
  14   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getCount(), 2 );
  15
  16   sl.setLeft(1);
  17   sl.setRight(3);
  18
  19   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getLeft(), 1 );
  20   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getRight(), 3 );
  21   BOOST_CHECK_EQUAL( sl.getCount(), 2 );
  22 }
  23
  24 BOOST_AUTO_TEST_CASE( memory_test )
  25 {
  26   SequenceLocation *sl;
  27   // storing references is a bad idea
  28   {
  29     Sequence s("AAGGCCTT");
  30     sl = new SequenceLocation(s, 0, 2);
  31   }
  32
  33   BOOST_CHECK_EQUAL(sl->getSequence(), "AAGGCCTT");
  34 }