gui/SeqWindow.cpp

   1 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   2 //  http://mussa.caltech.edu/
   3 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   4
   5 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   6 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
   7 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
   8 // file for more information, or contact Tristan directly.
   9
  10
  11 #include "gui/SeqWindow.hpp"
  12
  13 #include <sstream>
  14
  15 #include <FL/Fl.H>
  16
  17 using namespace std;
  18
  19 void
  20 set_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  21 {
  22   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  23   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  24   T->real_set_align_cb(blah->which_align);
  25 }
  26
  27
  28 void
  29 SeqWindow::real_set_align_cb(int which_align)
  30 {
  31   seq_box->align_offsets(which_align);
  32   seq_box->redraw();
  33 }
  34
  35
  36 void
  37 show_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  38 {
  39   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  40   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  41   T->real_show_align_cb(blah->which_align);
  42 }
  43
  44
  45 void
  46 SeqWindow::real_show_align_cb(int which_align)
  47 {
  48   vector<int> a_path;
  49   int window_length;
  50
  51
  52   cout << "fumish\n";
  53   seq_box->toggle_align(which_align);
  54   seq_box->redraw();
  55 }
  56
  57
  58 void
  59 toggle_bars_cb(Fl_Button* o, void* v)
  60 {
  61   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  62   T->real_toggle_bars_cb();
  63 }
  64
  65
  66 void
  67 SeqWindow::real_toggle_bars_cb()
  68 {
  69   seq_box->toggle_bars();
  70 }
  71
  72
  73 void
  74 toggle_motifs_cb(Fl_Button* o, void* v)
  75 {
  76   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  77   T->real_toggle_motifs_cb();
  78 }
  79
  80
  81 void
  82 SeqWindow::real_toggle_motifs_cb()
  83 {
  84   seq_box->toggle_motifs();
  85 }
  86
  87
  88 // main code, window creation
  89
  90 SeqWindow::SeqWindow(int w, int h, const char* title, int sq_num,
  91                      vector<Sequence> *some_seqs,
  92                      list<ExtendedConservedPath > some_paths,
  93                      vector<int> some_lens,
  94                      vector<motif> *some_motifs):
  95   Fl_Double_Window(w,h,title)
  96 {
  97   menu_align_data_bundle * some_menu_data;
  98   int window_length, align_number;
  99   int i;
 100   ostringstream align_id_ostr;
 101   string align_id_string;
 102   list<ExtendedConservedPath >::iterator align_iter;
 103
 104   // most of this stuff is here just to pass to SeqView object
 105   // some is needed to setup the window menus
 106   seq_num = sq_num;
 107   S = some_seqs;
 108   P = some_paths;
 109   seq_lens = some_lens;
 110   the_motifs = some_motifs;
 111
 112
 113   begin();
 114   color(FL_WHITE);
 115   resizable(this);
 116
 117   // make the menu that allows alignment selection
 118   choose_align_menu = new Fl_Menu_Button(5, 2, 180, 30, "Choose Alignment");
 119   choose_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 120   choose_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 121   choose_align_menu->clear();
 122
 123   // make the menu that allows alignment selection
 124   show_align_menu = new Fl_Menu_Button(190, 2, 180, 30, "Show Alignment");
 125   show_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 126   show_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 127   show_align_menu->clear();
 128
 129
 130   // adds menu items for each path
 131   align_iter = P.begin();
 132   align_number = 0;
 133   while(align_iter != P.end())
 134   {
 135     some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 136     some_menu_data->swm_ptr = this;
 137     some_menu_data->which_align = align_number;
 138     align_id_ostr << (*align_iter)[0] << ": ";
 139     for(i = 1; i <= seq_num; i++)
 140       align_id_ostr << (*align_iter)[i] << ", ";
 141     align_id_string = align_id_ostr.str();
 142     choose_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 143                            (Fl_Callback *) set_align_cb,
 144                            (void*) some_menu_data);
 145     show_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 146                          (Fl_Callback *) show_align_cb,
 147                          (void*) some_menu_data, FL_MENU_TOGGLE|FL_MENU_VALUE);
 148
 149     align_id_ostr.str("");
 150     ++align_number;
 151     ++align_iter;
 152   }
 153
 154   /*
 155   show_align_menu->add("f&ee");
 156   show_align_menu->add("f&ie");
 157   show_align_menu->add("f&oe");
 158   show_align_menu->add("f&um");
 159   */
 160
 161   Fl_Button *test_but = new Fl_Button(375, 2, 150, 30, "Toggle Motifs");
 162   test_but->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 163   test_but->box(FL_BORDER_BOX);
 164   test_but->callback((Fl_Callback*) toggle_motifs_cb, this);
 165
 166   toggle_bars = new Fl_Button(530, 2, 150, 30, "Toggle 10bp bars");
 167   toggle_bars->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 168   toggle_bars->box(FL_BORDER_BOX);
 169   toggle_bars->callback((Fl_Callback*) toggle_bars_cb, this);
 170
 171
 172   // make the view of the sequence
 173   seq_box = new SeqView(0, 34, w, h-34);
 174   seq_box->setup(analysis_name, seq_num, S, P, seq_lens, the_motifs);
 175   //real_set_align_cb(2);
 176
 177   end();
 178   Fl::visual(FL_DOUBLE|FL_INDEX);
 179   show();
 180 }
 181
 182
 183
 184 /*
 185   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 186   some_menu_data->swm_ptr = this;
 187   some_menu_data->which_align = 2;
 188   choose_align_menu->add("f&ie", FL_ALT+'i', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 189                   (void*) some_menu_data);
 190
 191   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 192   some_menu_data->swm_ptr = this;
 193   some_menu_data->which_align = 3;
 194   choose_align_menu->add("f&oe", FL_ALT+'o', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 195                   (void*) some_menu_data);
 196
 197   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 198   some_menu_data->swm_ptr = this;
 199   some_menu_data->which_align = 4;
 200   choose_align_menu->add("f&um", FL_ALT+'u', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 201                   (void*) some_menu_data);
 202 */
 203
 204
 205
 206