mussa_exceptions.hpp

   1 #ifndef _MUSSA_EXCEPTIONS_H_
   2 #define _MUSSA_EXCEPTIONS_H_
   3 #include <stdexcept>
   4 #include <boost/filesystem/exception.hpp>
   5
   6 //! base mussa exception
   7 class mussa_error : public std::runtime_error
   8 {
   9 public:
  10   explicit mussa_error(const std::string& msg): std::runtime_error(msg) {};
  11 };
  12
  13 //! Error processing commandline arguments
  14 class cmdline_error : public mussa_error
  15 {
  16 public:
  17   explicit cmdline_error(const std::string& msg): mussa_error(msg) {};
  18 };
  19 //! Error trying to save
  20 class mussa_save_error : public mussa_error
  21 {
  22 public:
  23   explicit mussa_save_error(const std::string& msg) :
  24     mussa_error(msg) {};
  25 };
  26 //! Error loading information
  27 class mussa_load_error : public mussa_error
  28 {
  29 public:
  30   explicit mussa_load_error(const std::string& msg) :
  31     mussa_error(msg) {};
  32 };
  33
  34 //! Error loading sequence
  35 class sequence_load_error : public mussa_load_error
  36 {
  37 public:
  38   explicit sequence_load_error(const std::string& msg) :
  39     mussa_load_error(msg) {};
  40 };
  41
  42 // Empty sequence
  43 class sequence_empty_error : public sequence_load_error
  44 {
  45 public:
  46   explicit sequence_empty_error(const std::string& msg) :
  47     sequence_load_error(msg) {};
  48 };
  49
  50 // Empty fasta file
  51 class sequence_empty_file_error : public sequence_load_error
  52 {
  53 public:
  54   explicit sequence_empty_file_error(const std::string& msg) :
  55     sequence_load_error(msg) {};
  56 };
  57
  58 // Empty unrecognized characters
  59 class sequence_invalid_load_error : public sequence_load_error
  60 {
  61 public:
  62   explicit sequence_invalid_load_error(const std::string& msg) :
  63     sequence_load_error(msg) {};
  64 };
  65
  66 //! Error loading sequence annotation
  67 class annotation_load_error : public sequence_load_error
  68 {
  69 public:
  70   explicit annotation_load_error(const std::string& msg) :
  71     sequence_load_error(msg) {};
  72 };
  73
  74 //! failure running analysis
  75 class mussa_analysis_error : public mussa_error
  76 {
  77 public:
  78   explicit mussa_analysis_error(const std::string& msg) :
  79     mussa_error(msg) {};
  80 };
  81
  82 //! failure running seqcomp
  83 class seqcomp_error : public mussa_analysis_error
  84 {
  85 public:
  86   explicit seqcomp_error(const std::string& msg) :
  87     mussa_analysis_error(msg) {};
  88 };
  89
  90 //! couldn't normalize a motif
  91 /*
  92 class motif_normalize_error : public mussa_error
  93 {
  94 public:
  95   explicit motif_normalize_error(const std::string& msg) :
  96     mussa_error(msg) {};
  97 };
  98 */
  99
 100 //! something went wrong loading a motif
 101 class motif_load_error : public mussa_load_error
 102 {
 103 public:
 104   explicit motif_load_error(const std::string& msg) :
 105     mussa_load_error(msg) {};
 106 };
 107
 108 //! ConservedPath::nextTo had two paths that weren't the same size
 109 class conserved_path_size_mismatch : public mussa_error
 110 {
 111 public:
 112   explicit conserved_path_size_mismatch(const std::string& msg) :
 113     mussa_error(msg) {};
 114 };
 115 #endif