mussa_exceptions.hpp

   1 #ifndef _MUSSA_EXCEPTIONS_H_
   2 #define _MUSSA_EXCEPTIONS_H_
   3 #include <stdexcept>
   4 #include <boost/filesystem/exception.hpp>
   5
   6 //! base mussa exception
   7 class mussa_error : public std::runtime_error
   8 {
   9 public:
  10   explicit mussa_error(const std::string& msg): std::runtime_error(msg) {};
  11 };
  12
  13 //! Error processing commandline arguments
  14 class cmdline_error : public mussa_error
  15 {
  16 public:
  17   explicit cmdline_error(const std::string& msg): mussa_error(msg) {};
  18 };
  19 //! Error trying to save
  20 class mussa_save_error : public mussa_error
  21 {
  22 public:
  23   explicit mussa_save_error(const std::string& msg) :
  24     mussa_error(msg) {};
  25 };
  26 //! Error loading information
  27 class mussa_load_error : public mussa_error
  28 {
  29 public:
  30   explicit mussa_load_error(const std::string& msg) :
  31     mussa_error(msg) {};
  32 };
  33
  34 //! Error loading sequence
  35 class sequence_load_error : public mussa_load_error
  36 {
  37 public:
  38   explicit sequence_load_error(const std::string& msg) :
  39     mussa_load_error(msg) {};
  40 };
  41
  42 // Empty sequence
  43 class sequence_empty_error : public sequence_load_error
  44 {
  45 public:
  46   explicit sequence_empty_error(const std::string& msg) :
  47     sequence_load_error(msg) {};
  48 };
  49
  50 // Empty fasta file
  51 class sequence_empty_file_error : public sequence_load_error
  52 {
  53 public:
  54   explicit sequence_empty_file_error(const std::string& msg) :
  55     sequence_load_error(msg) {};
  56 };
  57
  58 // Empty unrecognized characters
  59 class sequence_invalid_load_error : public sequence_load_error
  60 {
  61 public:
  62   explicit sequence_invalid_load_error(const std::string& msg) :
  63     sequence_load_error(msg) {};
  64 };
  65 //! failure running analysis
  66 class mussa_analysis_error : public mussa_error
  67 {
  68 public:
  69   explicit mussa_analysis_error(const std::string& msg) :
  70     mussa_error(msg) {};
  71 };
  72
  73 class motif_normalize_error : public mussa_error
  74 {
  75 public:
  76   explicit motif_normalize_error(const std::string& msg) :
  77     mussa_error(msg) {};
  78 };
  79
  80 //! ConservedPath::nextTo had two paths that weren't the same size
  81 class conserved_path_size_mismatch : public mussa_error
  82 {
  83 public:
  84   explicit conserved_path_size_mismatch(const std::string& msg) :
  85     mussa_error(msg) {};
  86 };
  87 #endif